Proteomická analýza vzorků kondenzátu vydechovaného vzduchu prokázala vysokou reprodukovatelnost hmotnostně spektrometrických měření
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15110%2F20%3A73605517" target="_blank" >RIV/61989592:15110/20:73605517 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/3641/3578" target="_blank" >http://www.chemicke-listy.cz/ojs3/index.php/chemicke-listy/article/view/3641/3578</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Proteomická analýza vzorků kondenzátu vydechovaného vzduchu prokázala vysokou reprodukovatelnost hmotnostně spektrometrických měření
Popis výsledku v původním jazyce
Odběr kondenzátu vydechovaného vzduchu (EBC, zangl. Exhaled Breath Condensate) je jednoduchá, neinva-zivní, a tedy slibná metoda, pomocí které můžeme získat vzorek komplexního materiálu zdýchacích cest. Konden-zát vydechovaného vzduchu je možné jednoduše odebrat anásledně analyzovat i vpřípadě pacientů z řad dětí před-školního věku1,2. Odběr EBC bývá prováděn svyužitím různých odběrových přístrojů, a to buď vlastními, nebo komerčně dostupnými zařízeními. Zkomerčně dostupných zařízení lze zmínit EcoScreen, TurboDECCS, RTube, askleněný kondenzátor Anacon glass.
Název v anglickém jazyce
Proteomic Analysis of Exhaled Breath Condensate Samples: High Reproducibility of Mass Spectrometric Measurements
Popis výsledku anglicky
Exhaled breath condensate is considered a rich source of biomarkers that can provide valuable information for early diagnosis of respiratory and systemic diseases. However, exhaled breath condensate (EBC) consists mainly of water vapor and the concentration of analytes in the exhaled breath condensate sample is very low, close to the detection limit of sensitive methods such as mass spectrometry. Here, we have developed a mass spectrometry-based approach to characterize the EBC proteome. We compared biological and technical replicates of the measured samples, compared the protein profile between individual samples of healthy individuals and described the reproducibility between the three technical replicates of the sample taken. We have found that repeated measurements of samples are reproducible and can increase the number of proteins identified. Analysis led to the detection of 2797 unique proteins in all samples. Based on statistical analysis, it was shown that the 10% difference from the mean is due more to the deviation of the mass spectrometry measurements than to the biological variability of the samples. And second, the change in protein amount below 20% of the average in the case of EBC is due to method variability and should not be considered a significant change in protein expression using label-free mass spectrometry techniques.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10608 - Biochemistry and molecular biology
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/NV16-32302A" target="_blank" >NV16-32302A: Kondenzát vydechovaného vzduchu jako zdroj proteomických biomarkerů pro neinvazivní hodnocení plicního postižení u asthmatu a cystické fibrózy.</a><br>
Návaznosti
—
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
CHEMICKE LISTY
ISSN
0009-2770
e-ISSN
—
Svazek periodika
114
Číslo periodika v rámci svazku
7
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
470-479
Kód UT WoS článku
000549181700008
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85090752735