Rozdělení velkých genomů: třídění chromozomů pšenice a jejich klonování do vektoru BAC
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F04%3A00002449" target="_blank" >RIV/61989592:15310/04:00002449 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61389030:_____/04:00107485
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Dissecting large and complex genomes: flow sorting and BAC cloning of individual chromosomes from bread wheat
Popis výsledku v původním jazyce
The analysis of the complex genome of common wheat (Triticum aestivum, 2n = 6x = 42, genome formula AABBDD) is hampered by its large size (similar to17 000 Mbp) and allohexaploid nature. In order to simplify its analysis, we developed a generic strategyfor dissecting such large and complex genomes into individual chromosomes. Chromosome 3B was successfully sorted by flow cytometry and cloned into a bacterial artificial chromosome (BAC), using only 1.8 million chromosomes and an adapted protocol developed for this purpose. The BAC library (designated as TA-3B) consists of 67 968 clones with an average insert size of 103 kb. It represents 6.2 equivalents of chromosome 3B with 100% coverage and 90% specificity as confirmed by genetic markers. This methodwas validated using other chromosomes and its broad application and usefulness in facilitating wheat genome analysis were demonstrated by target characterization of the chromosome 3B structure through cytogenetic mapping. This report on
Název v anglickém jazyce
Dissecting large and complex genomes: flow sorting and BAC cloning of individual chromosomes from bread wheat
Popis výsledku anglicky
The analysis of the complex genome of common wheat (Triticum aestivum, 2n = 6x = 42, genome formula AABBDD) is hampered by its large size (similar to17 000 Mbp) and allohexaploid nature. In order to simplify its analysis, we developed a generic strategyfor dissecting such large and complex genomes into individual chromosomes. Chromosome 3B was successfully sorted by flow cytometry and cloned into a bacterial artificial chromosome (BAC), using only 1.8 million chromosomes and an adapted protocol developed for this purpose. The BAC library (designated as TA-3B) consists of 67 968 clones with an average insert size of 103 kb. It represents 6.2 equivalents of chromosome 3B with 100% coverage and 90% specificity as confirmed by genetic markers. This methodwas validated using other chromosomes and its broad application and usefulness in facilitating wheat genome analysis were demonstrated by target characterization of the chromosome 3B structure through cytogenetic mapping. This report on
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2004
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Plant Journal
ISSN
0960-7412
e-ISSN
—
Svazek periodika
39
Číslo periodika v rámci svazku
6
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
960-968
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—