Photodynamics of the adenine model 4-aminopyrimidine embedded within double strand of DNA
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F11%3A33118240" target="_blank" >RIV/61989592:15310/11:33118240 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/61388963:_____/11:00364629
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1135/cccc2011046" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1135/cccc2011046</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1135/cccc2011046" target="_blank" >10.1135/cccc2011046</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Photodynamics of the adenine model 4-aminopyrimidine embedded within double strand of DNA
Popis výsledku v původním jazyce
On-the-fly surface hopping nonadiabatic photodynamical simulations using hybrid quantum mechanical/molecular mechanical approach of 4-aminopyrimidine were performed to model the relaxation mechanism of adenine within DNA double strand. The surrounding bases do not affect the overall ring-puckering relaxation mechanisms significantly, however, interesting hydrogen-bond dynamics is observed. First, formation of intra-strand hydrogen bonds is found. It is shown that this effect speeds up the decay process.In addition, the Watson-Crick structure is altered by breaking one of the inter-strand hydrogen bonds also leading to a decrease of the life time.
Název v anglickém jazyce
Photodynamics of the adenine model 4-aminopyrimidine embedded within double strand of DNA
Popis výsledku anglicky
On-the-fly surface hopping nonadiabatic photodynamical simulations using hybrid quantum mechanical/molecular mechanical approach of 4-aminopyrimidine were performed to model the relaxation mechanism of adenine within DNA double strand. The surrounding bases do not affect the overall ring-puckering relaxation mechanisms significantly, however, interesting hydrogen-bond dynamics is observed. First, formation of intra-strand hydrogen bonds is found. It is shown that this effect speeds up the decay process.In addition, the Watson-Crick structure is altered by breaking one of the inter-strand hydrogen bonds also leading to a decrease of the life time.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CF - Fyzikální chemie a teoretická chemie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Collection of Czechoslovak Chemical Communications
ISSN
0010-0765
e-ISSN
—
Svazek periodika
76
Číslo periodika v rámci svazku
6
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
13
Strana od-do
631-643
Kód UT WoS článku
000291434900001
EID výsledku v databázi Scopus
—