Programová aplikace pro předpověď výsledků štěpení proteinů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F13%3A33147807" target="_blank" >RIV/61989592:15310/13:33147807 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2013_01_44-53.pdf" target="_blank" >http://www.chemicke-listy.cz/docs/full/2013_01_44-53.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Programová aplikace pro předpověď výsledků štěpení proteinů

Popis výsledku v původním jazyce

Protein Cutter je webová aplikace pro predikci výsledků štěpení proteinů pomocí proteolytických enzymů, která je přístupná prostřednictvím sítě Internet. Program Protein Cutter umožňuje předpovídat sekvence peptidů tvořených proteolytickým štěpením proteinu (daných aminokyselinovou sekvencí nebo kódující nukleotidovou sekvencí). Na rozdíl od jiných srovnatelných aplikací poskytuje Protein Cutter komplexnější informace vypočtené z aminokyselinových sekvencí (např. molekulová hmotnost, aminokyselinové složení, izoelektrický bod, index hydropathie atd.), pracuje s nukleotidovými sekvencemi po automatickém překladu, umožňuje nastavení pravidel štěpení uživatelem a poskytuje další možnosti pro filtraci a třídění výsledků.

Název v anglickém jazyce

Program Application for the Prediction of Results of Protein Digestion by Proteolytic Enzymes

Popis výsledku anglicky

Here we introduce the Protein Cutter (http:// biochemie.upol.cz/software/proteincutter), a web application for the prediction of results of protein digestion by proteolytic enzymes, which is accessible over the Internet network. In the beginning, previous and current approaches for protein sequencing are summarized. This includes the use of dinitrofluorobenzene and substituted isothiocyanate reagents as well as mass-spectrometry-based strategies and translation of genomic sequences. The following text characterizes bioinformatics as a modern scientific discipline, which solves problems arising from the management and analysis of biological data. The most important nucleotide and amino acid sequence databases are described together with the databases ofDNA and protein structures. The program Protein Cutter, which is described in detail with respect to its design and technology, allows predicting peptide sequences generated by proteolytic digestion of a protein (represented by a user-en

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

CE - Biochemie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/ED0007%2F01%2F01" target="_blank" >ED0007/01/01: Centrum regionu Haná pro biotechnologický a zemědělský výzkum</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Chemické listy

ISSN

0009-2770

e-ISSN

—

Svazek periodika

107

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

10

Strana od-do

44-53

Kód UT WoS článku

000314263100008

EID výsledku v databázi Scopus

—