OverProt: secondary structure consensus for protein families
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F61989592%3A15310%2F22%3A73614001" target="_blank" >RIV/61989592:15310/22:73614001 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14310/22:00127334
Výsledek na webu
<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article/38/14/3648/6604272" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article/38/14/3648/6604272</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btac384" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btac384</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
OverProt: secondary structure consensus for protein families
Popis výsledku v původním jazyce
Every protein family has a set of characteristic secondary structures. However, due to individual variations, a single structure is not enough to represent the whole family. OverProt can create a secondary structure consensus, showing the general fold of the family as well as its variation. Our server provides precomputed results for all CATH superfamilies and user-defined computations, visualized by an interactive viewer, which shows the secondary structure element type, length, frequency of occurrence, spatial variability and β-connectivity. Availability and implementation OverProt Server is freely available at https://overprot.ncbr.muni.cz.
Název v anglickém jazyce
OverProt: secondary structure consensus for protein families
Popis výsledku anglicky
Every protein family has a set of characteristic secondary structures. However, due to individual variations, a single structure is not enough to represent the whole family. OverProt can create a secondary structure consensus, showing the general fold of the family as well as its variation. Our server provides precomputed results for all CATH superfamilies and user-defined computations, visualized by an interactive viewer, which shows the secondary structure element type, length, frequency of occurrence, spatial variability and β-connectivity. Availability and implementation OverProt Server is freely available at https://overprot.ncbr.muni.cz.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10602 - Biology (theoretical, mathematical, thermal, cryobiology, biological rhythm), Evolutionary biology
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2022
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
BIOINFORMATICS
ISSN
1367-4803
e-ISSN
1460-2059
Svazek periodika
38
Číslo periodika v rámci svazku
14
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
3
Strana od-do
3648-3650
Kód UT WoS článku
000812249100001
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85134911267