Sekvenční analýza genů z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F13%3A00209756" target="_blank" >RIV/62156489:43210/13:00209756 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Sekvenční analýza genů z biosyntetické dráhy anthokyanů pšenice

Popis výsledku v původním jazyce

Anthokyany, flavonoidní látky, jsou zodpovědné za rozdílné zbarvení obilek pšenice seté (Triticum aestivum L.). Pigmenty tvořené biosyntetickou drahou anthokyanů jsou ukládány v různých částech obilky. Purpurové pigmenty jsou akumulovány v perikarpu a modré pigmenty v aleuronové vrstvě obilky. V pokusech byly použity jarní formy pšenice, dva genotypy s purpurově zbarveným perikarpem a dva genotypy s modře zbarvenou aleuronovu vrstvou. Genotyp s bílou obilkou sloužil jako kontrola. Z vyvíjejících se obilek byla izolována celková RNA. Pomocí reverzní transkripce byla získána cDNA. Na základě sekvenace získaných DNA fragmentů byly detekovány kandidátní sekvence genů pro chalkonisomerasu (podobnost 98-100%), pro dihydroflavonolreduktasu (95-100% podobnost)a pro anthokyanidinsynthasu. Variabilita zjištěná mezi studovanými genotypy byla způsobena jednonukleotidovými polymorfismy a indely. Získané sekvence byly lokalizovány v genomu pšenice.

Název v anglickém jazyce

Sequence analysis of genes from wheat anthocyanin biosynthetic pathway

Popis výsledku anglicky

Anthocyanins, the group of flavonoid substance, are responsible for colored caryopses of common wheat (Triticum aestivum L.). Pigments formed in anthocyanin biosynthetic pathway are deposited in different parts of caryopsis. Purple anthocyanins are accumulated in pericarp while blue anthocyanins are stored in the aleurone layer of caryopsis. The spring wheat form of two genotypes with purple pericarp and two genotypes with blue aleuron layer were used in the experiments. Genotype with white caryopsis was used as a control. A total RNA was isolated from developing caryopses and transcribed into cDNA. We detected sequences for chalcon isomerase (98-100% similarity), for dihydroflavonol reductase genes (95-100% similarity) and for anthocyanidin synthase genes. The variability among genotypes in this study was due to insertion or deletion (indels). These candidate sequences were localized in the wheat genome.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Úroda

ISSN

0139-6013

e-ISSN

—

Svazek periodika

2013

Číslo periodika v rámci svazku

12

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

177-181

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—