Elucidating protein posttranslational modifications using combination of recombinant protein spectral library and in silico designed SRM analysis

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F15%3A43906942" target="_blank" >RIV/62156489:43210/15:43906942 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Elucidating protein posttranslational modifications using combination of recombinant protein spectral library and in silico designed SRM analysis

Popis výsledku v původním jazyce

Posttranslational modifications (PTMs) of proteins represent fascinating extensions of the dynamic complexity of proteomes of living cells, but also present a difficult obstacle in the proteome analysis. Identification and mapping of PTMs in proteins have improved dramatically, but to comprehend complex mechanisms and biological functions, one must address also very low abundant proteins. Here, we demonstrate in silico derived analysis of a low abundant target of ubiquitination and the MS/MS identification of the predicted ubiquitination sites.

Název v anglickém jazyce

Elucidating protein posttranslational modifications using combination of recombinant protein spectral library and in silico designed SRM analysis

Popis výsledku anglicky

Posttranslational modifications (PTMs) of proteins represent fascinating extensions of the dynamic complexity of proteomes of living cells, but also present a difficult obstacle in the proteome analysis. Identification and mapping of PTMs in proteins have improved dramatically, but to comprehend complex mechanisms and biological functions, one must address also very low abundant proteins. Here, we demonstrate in silico derived analysis of a low abundant target of ubiquitination and the MS/MS identification of the predicted ubiquitination sites.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2015

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

MendelNet 2015: Proceedings of International PhD Students Conference

ISBN

978-80-7509-363-9

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

409-411

Název nakladatele

Mendelova univerzita v Brně

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

11. 11. 2015

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

000366466100075