Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Ten quick tips for homology modeling of high-resolution protein 3D structures

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43210%2F20%3A43917727" target="_blank" >RIV/62156489:43210/20:43917727 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/00216305:26620/20:PU136581

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007449" target="_blank" >https://doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007449</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1371/journal.pcbi.1007449" target="_blank" >10.1371/journal.pcbi.1007449</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Ten quick tips for homology modeling of high-resolution protein 3D structures

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The purpose of this quick guide is to help new modelers who have little or no background in comparative modeling yet are keen to produce high-resolution protein 3D structures for their study by following systematic good modeling practices, using affordable personal computers or online computational resources. Through the available experimental 3D-structure repositories, the modeler should be able to access and use the atomic coordinates for building homology models. We also aim to provide the modeler with a rationale behind making a simple list of atomic coordinates suitable for computational analysis abiding to principles of physics (e.g., molecular mechanics). Keeping that objective in mind, these quick tips cover the process of homology modeling and some postmodeling computations such as molecular docking and molecular dynamics (MD). A brief section was left for modeling nonprotein molecules, and a short case study of homology modeling is discussed.

  • Název v anglickém jazyce

    Ten quick tips for homology modeling of high-resolution protein 3D structures

  • Popis výsledku anglicky

    The purpose of this quick guide is to help new modelers who have little or no background in comparative modeling yet are keen to produce high-resolution protein 3D structures for their study by following systematic good modeling practices, using affordable personal computers or online computational resources. Through the available experimental 3D-structure repositories, the modeler should be able to access and use the atomic coordinates for building homology models. We also aim to provide the modeler with a rationale behind making a simple list of atomic coordinates suitable for computational analysis abiding to principles of physics (e.g., molecular mechanics). Keeping that objective in mind, these quick tips cover the process of homology modeling and some postmodeling computations such as molecular docking and molecular dynamics (MD). A brief section was left for modeling nonprotein molecules, and a short case study of homology modeling is discussed.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    PLoS Computational Biology

  • ISSN

    1553-734X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    16

  • Číslo periodika v rámci svazku

    4

  • Stát vydavatele periodika

    US - Spojené státy americké

  • Počet stran výsledku

    19

  • Strana od-do

    "e1007449"

  • Kód UT WoS článku

    000531366700011

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85082980198