OPTIMALIZACE MOLEKULÁRNÍCH METOD K SIMULTÁNNÍ DETEKCI NEPOVIRŮ RONCETU RÉVY VINNÉ (GFLV) A MOZAIKY HUSENÍKU (ArMV)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43510%2F10%3A00166466" target="_blank" >RIV/62156489:43510/10:00166466 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
OPTIMALIZACE MOLEKULÁRNÍCH METOD K SIMULTÁNNÍ DETEKCI NEPOVIRŮ RONCETU RÉVY VINNÉ (GFLV) A MOZAIKY HUSENÍKU (ArMV)
Popis výsledku v původním jazyce
Předmětem práce bylo optimalizovat molekulární metodu reverzně transkripční polymerázovou řetězovou reakci (RT-PCR) tak, aby umožnila detekci nepovirů roncetu révy vinné (GFLV) nebo mozaiky huseníku (ArMV) v rámci jednoho experimentu. Tyto dva nepoviry jsou si z hlediska genomu a chování v rostlinných buňkách velmi podobné, proto bylo možné nalézt v rámci genomové RNA2 obou virů vysoce konzervativní sekvence v oblasti kódující pohybový protein (2BMP). Degenerované primery z této oblasti byly nejprve testovány na izolátech s ověřenou infekcí jedním z virů. Následně byly úspěšně použity i u podezřelých izolátů s mírnými příznaky (tzv. "mild" izoláty), v nichž nebyly detekovány nepoviry žádnou jinou běžně používanou primerovou kombinací.
Název v anglickém jazyce
The optimization of the molecular methods for simultaneous detection of nepoviruses Grapevine fanleaf virus and Arabis mosaic virus
Popis výsledku anglicky
The study was focused on the optimalization of molecular method reverse transcription polymerase chain reaction (RT-PCR) for the simplification of GFLV and ArMV nepoviruses simultaneous detection. These nepoviruses are silimilar in the frame of genome and behaviour at the plant tissues. It was possible to find the most holologous region in RNA2 and this sequence is coding the movement protein 2BMP. Firstly, the degenerate primers from this region were tested on positive isolates. Subsequently the "mild"isolates were tested with positive results. These "mild" isolates did not show virus presence with previously used primer pairs.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QH91214" target="_blank" >QH91214: Nové biotechnologické postupy pro navození rezistence podnoží révy vinné proti nepovirům</a><br>
Návaznosti
V - Vyzkumna aktivita podporovana z jinych verejnych zdroju
Ostatní
Rok uplatnění
2010
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Úroda, vědecká příloha
ISSN
0139-6013
e-ISSN
—
Svazek periodika
12
Číslo periodika v rámci svazku
12
Stát vydavatele periodika
CZ - Česká republika
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—