Genetic variability of Grapevine fanleaf virus isolates within genes 1B(HEL) and 1E(POL)
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43510%2F11%3A00174486" target="_blank" >RIV/62156489:43510/11:00174486 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Genetic variability of Grapevine fanleaf virus isolates within genes 1B(HEL) and 1E(POL)
Popis výsledku v původním jazyce
The genetic variability of six isolates of Grapevine fanleaf virus (GFLV) from South Moravia (Czech Republic) and Italy was investigated by RT-PCR and sequencing within part of the RNA-1-encoded genes 1B(Hel) (379 nts) and 1E(Pol) (365 nts). Sequence analyses showed 96-100% and 91.4-100% identity at the amino acid level for genes 1B(Hel) and 1E(Pol), respectively, among Czech, Italian and other isolates for which sequence information is available. As expected, some of the conserved motifs of the helicase and polymerase proteins were found in the deduced amino acid sequences, although isolates PN33 from Czech Republic, and isolates 55TK and UR11 from Italy had a Ile to Val subtitution in the helicase motif B. Phylogenetic analyses confirmed the close relationship among GFLV isolates and the relatedness of GFLV isolate WAPN173 with Arabis mosaic virus (ArMV) in protein 1B(Hel). Two distinct phylogenetic clusters were identified for protein 1E(Pol), with isolates from California and the F
Název v anglickém jazyce
Genetic variability of Grapevine fanleaf virus isolates within genes 1B(HEL) and 1E(POL)
Popis výsledku anglicky
The genetic variability of six isolates of Grapevine fanleaf virus (GFLV) from South Moravia (Czech Republic) and Italy was investigated by RT-PCR and sequencing within part of the RNA-1-encoded genes 1B(Hel) (379 nts) and 1E(Pol) (365 nts). Sequence analyses showed 96-100% and 91.4-100% identity at the amino acid level for genes 1B(Hel) and 1E(Pol), respectively, among Czech, Italian and other isolates for which sequence information is available. As expected, some of the conserved motifs of the helicase and polymerase proteins were found in the deduced amino acid sequences, although isolates PN33 from Czech Republic, and isolates 55TK and UR11 from Italy had a Ile to Val subtitution in the helicase motif B. Phylogenetic analyses confirmed the close relationship among GFLV isolates and the relatedness of GFLV isolate WAPN173 with Arabis mosaic virus (ArMV) in protein 1B(Hel). Two distinct phylogenetic clusters were identified for protein 1E(Pol), with isolates from California and the F
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QH91214" target="_blank" >QH91214: Nové biotechnologické postupy pro navození rezistence podnoží révy vinné proti nepovirům</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of Plant Pathology
ISSN
1125-4653
e-ISSN
—
Svazek periodika
93
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
IT - Italská republika
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
511-515
Kód UT WoS článku
293602400034
EID výsledku v databázi Scopus
—