'Candidatus Phytoplasma prunorum' (ESFY) Strain Chracterization in Experimental Orchard of Department of Fruit Growing at Faculty of Horticulture, MENDELU in Brno

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43510%2F16%3A43909640" target="_blank" >RIV/62156489:43510/16:43909640 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

slovinština

Název v původním jazyce

Charakterizácia kmeňov 'Candidatus Phytoplasma prunorum' (ESFY) vyskytujúcich sa v experimentálnom sade Ústavu ovocnictví Záhradníckej fakulty, MENDELU v Brně

Popis výsledku v původním jazyce

Na charakterizáciu kmeňov fytoplazmy 'Ca. P. prunorum' boli použité molekulárne markery aceF, imp, pnp, secY. V publikácii Danet et al. (2011) ich osekvenovaním a najmä vďaka markeru aceF bolo možné rozlíšiť hypovirulentné kmene. Ďalšou analýzou bola RFLP analýza markeru aceF, pomocou ktorej bolo možné analyzovať zmiešané infekcie fytoplazmou 'Ca. P. prunorum'. Analýzou molekulárnych markerov (aceF, imp, pnp a secY) fytoplazmy 'Ca. P. prunorum' vzoriek z experimentálneho sadu Ústavu ovocnictví nebolo možné rozlíšiť kandidátne hypovirulentné kmene, ktoré sa navzájom odlišovali genotypovým zložením použitých markerov a na úrovni týchto markerov neboli ani odlíšiteľné od ostatných kmeňov použitých v tejto práci. RFLP analýzou markeru aceF i analýzou sekvencii markerov použitých vzoriek boli sledované zmiešané infekcie 'Ca. P. prunorum' u 5 vzoriek. Nové sekvencie genotypov markerov aceF, imp a pnp a iný podiel genotypového zloženia markerov testovaných vzoriek v porovnaní s výsledkami v práci Danet et al. (2011), kde prevládali vzorky zo západnej Európy, je možné, že v oblasti Lednice došlo k izolovanému vývoju fytoplazmy 'Ca. P. prunorum'.

Název v anglickém jazyce

'Candidatus Phytoplasma prunorum' (ESFY) Strain Chracterization in Experimental Orchard of Department of Fruit Growing at Faculty of Horticulture, MENDELU in Brno

Popis výsledku anglicky

To characterize the strains of 'Ca. P. prunorum', molecular markers aceF, imp, pnp and secY were analysed. By their sequencing and mainly due to the marker aceF it was possible to distinguish hypovirulent strains in the publication by Danet et al. (2011). Next step was the RFLP analysis of aceF marker which enables to analyze the mixed infections by phytoplasma 'Ca. P. prunorum'. By analyses of molecular markers (aceF, imp, pnp and secY) of phytoplasma 'Ca. P. prunorum' samples from the experimental orchard of Department of Fruit Growing was not possible to distinguish candidate hypovirulent strains. Besides, they differed between each other by genotypic composition of markers and were not distinguishable by analyses of these markers from other samples used in this work. RFLP analyses of marker aceF and sequence analyses of molecular markers showed mixed infections of 'Ca. P. prunorum' in 5 samples. The unique sequences of markers aceF, imp and pnp and different ratio of genotypic composition of tested samples compared to the results of work by Danet et al. (2011), where the majority of samples derived from Western Europe, it is possible that isolated development of phytoplasma 'Ca. P. prunorum' occured in the area of Lednice.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GC - Pěstování rostlin, osevní postupy

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/QJ1510352" target="_blank" >QJ1510352: Hodnocení faktorů ovlivňujících škodlivost fytoplazem napadajících ovocné dřeviny a ověřování účinných prostředků jejich eliminace</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Veda mladých 2016: zborník príspevkov

ISBN

978-80-552-1535-8

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

14

Strana od-do

60-73

Název nakladatele

Slovenská poľnohospodárska univerzita v Nitre

Místo vydání

Nitra

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

7. 9. 2016

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—