Characterisation of 'Candidatus Phytoplasma prunorum' strains in Czech Republic
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62156489%3A43510%2F17%3A43912337" target="_blank" >RIV/62156489:43510/17:43912337 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://pgsha.ru/export/sites/default/studyprocess/sp_files/Smotra-2017-zbornik-radova.pdf" target="_blank" >http://pgsha.ru/export/sites/default/studyprocess/sp_files/Smotra-2017-zbornik-radova.pdf</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Characterisation of 'Candidatus Phytoplasma prunorum' strains in Czech Republic
Popis výsledku v původním jazyce
Molecular markers (aceF, imp, pnp and secY) are used for strain characterisation of 'Candidatus Phytoplasma prunorum'. By sequencing of marker aceF should be possible to distinguish hypovirulent strains and its RFLP analysis enables monitoring of mixed infections of 'Ca. P. prunorum' strains in samples. In this study 28 Prunus samples from experimental orchard in Lednice (Czech Republic) were used for strain characterisation of 'Ca. P. prunorum'. As a result of RFLP analysis of aceF marker 5 samples were infected by mixed infections. Sequence analysis of aceF, imp, pnp and secY markers reveald new genotypes of 'Ca. P. prunorum'. New genotypes and comparison of genotype composition of 'Ca. P. prunorum' with other studies could indicate isolated evolution of 'Ca. P. prunorum' in Lednice region. Finally, by sequencing of aceF marker it was not possible to distinguish candidate hypovirulent strains.
Název v anglickém jazyce
Characterisation of 'Candidatus Phytoplasma prunorum' strains in Czech Republic
Popis výsledku anglicky
Molecular markers (aceF, imp, pnp and secY) are used for strain characterisation of 'Candidatus Phytoplasma prunorum'. By sequencing of marker aceF should be possible to distinguish hypovirulent strains and its RFLP analysis enables monitoring of mixed infections of 'Ca. P. prunorum' strains in samples. In this study 28 Prunus samples from experimental orchard in Lednice (Czech Republic) were used for strain characterisation of 'Ca. P. prunorum'. As a result of RFLP analysis of aceF marker 5 samples were infected by mixed infections. Sequence analysis of aceF, imp, pnp and secY markers reveald new genotypes of 'Ca. P. prunorum'. New genotypes and comparison of genotype composition of 'Ca. P. prunorum' with other studies could indicate isolated evolution of 'Ca. P. prunorum' in Lednice region. Finally, by sequencing of aceF marker it was not possible to distinguish candidate hypovirulent strains.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
—
OECD FORD obor
40106 - Agronomy, plant breeding and plant protection; (Agricultural biotechnology to be 4.4)
Návaznosti výsledku
Projekt
<a href="/cs/project/QJ1510352" target="_blank" >QJ1510352: Hodnocení faktorů ovlivňujících škodlivost fytoplazem napadajících ovocné dřeviny a ověřování účinných prostředků jejich eliminace</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)
Ostatní
Rok uplatnění
2017
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Proceedings Conference of Agronomy Students
ISBN
—
ISSN
2334-9883
e-ISSN
neuvedeno
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
17-27
Název nakladatele
University of Kragujevac
Místo vydání
Čačak
Místo konání akce
Čačak
Datum konání akce
23. 8. 2017
Typ akce podle státní příslušnosti
EUR - Evropská akce
Kód UT WoS článku
—