Porování tří metod přípravy teplátu pro rutinní detekci viru PBFD a aviárního polyomaviru pomocí jednoduché a nested PCR z klinických vzorků
Popis výsledku
Přímé srovnání je důležité když hodnotíme význam DNA extrakčních metod pro diagnostikou virologii jak jsou inhibioty přítomné a účinnost extrace může být různá podle cílového infekčního agens stejně jako druhu a místa, ze kterého byl klinický vzorek získán . Tři DNA extrakční metody byly porovnány pro rutinní PCR detekci BFDV v plné krvi a ze vzorků peří a pro aviární polyomavirus (APV) ve vzorcích peří. Var v Chelexu 100 Resin byl zjištěn jako nejcitlivější metoda pro detekci BFDV nebo APV DNA jak ve vzorcích krve tak peří. V kombinaci s nested PCR to umožnilo detekci BFDV DNA u 13/13 pozitivní vzorků krve a v 22/23 pozitivní vzorcích peří. Také umožnilo tedtekci APV v 31/31 vzorků detekovaných jako pozitivní v této studii. NucleSpin kit umožnil detekci BFDV DNA pouze v 9/13 krevních vzorcích a v 18/23 vzorcích peří. Nižší frekvence BFDV DNA detekci při použití NucleoSpin kitu nebyla výsledkem inhibice PCR ve většině případů. NucleoSpin Tissue Kit umožnil detekci APV DNA v 29/31 vzork
Klíčová slova
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Comparison of three template preparation methods for routine detection of beak and feather disease virus and avian polyomavirus with single and nested polymerase chain reaction in clinical specimens
Popis výsledku v původním jazyce
Direct comparisons are important when assessing the value of DNA extraction methods for diagnostic virology as the inhibitors present and the efficiency of extraction vary with the target infectious agent as well as the species and the site from which the clinical sample was obtained. Three DNA extraction methods were compared for routine polymerase chain reaction (PCR) detection of beak and feather disease virus (BFDV) in whole blood and feather samples and of avian polyomavirus (APV) in feather samples. Boiling in Chelex 100 Resin was found to be the most sensitive method for detection of BFDV or APV DNA in both feather and blood samples. In combination with nested PCR it enabled detection of BFDV DNA in 13/13 positive whole blood samples and in 22/23 positive feather samples. It also enabled detection of APV in 31/31 samples detected as positive in this study. NucleoSpin kits enabled detection of BFDV DNA in only 9/13 blood samples and in 18/23 feather samples. The lower rate of BFD
Název v anglickém jazyce
Comparison of three template preparation methods for routine detection of beak and feather disease virus and avian polyomavirus with single and nested polymerase chain reaction in clinical specimens
Popis výsledku anglicky
Direct comparisons are important when assessing the value of DNA extraction methods for diagnostic virology as the inhibitors present and the efficiency of extraction vary with the target infectious agent as well as the species and the site from which the clinical sample was obtained. Three DNA extraction methods were compared for routine polymerase chain reaction (PCR) detection of beak and feather disease virus (BFDV) in whole blood and feather samples and of avian polyomavirus (APV) in feather samples. Boiling in Chelex 100 Resin was found to be the most sensitive method for detection of BFDV or APV DNA in both feather and blood samples. In combination with nested PCR it enabled detection of BFDV DNA in 13/13 positive whole blood samples and in 22/23 positive feather samples. It also enabled detection of APV in 31/31 samples detected as positive in this study. NucleoSpin kits enabled detection of BFDV DNA in only 9/13 blood samples and in 18/23 feather samples. The lower rate of BFD
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2008
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Avian Pathology
ISSN
0307-9457
e-ISSN
—
Svazek periodika
37
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
5
Strana od-do
—
Kód UT WoS článku
000260907600029
EID výsledku v databázi Scopus
—
Základní informace
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
Rok uplatnění
2008