A novel Ion AMpliSeq-based typing method of Toxoplasma gondii reveals aN ExCELLENT typing resolution among European type II straiNs
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16170%2F22%3A43880125" target="_blank" >RIV/62157124:16170/22:43880125 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/62157124:16810/22:43880125
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
A novel Ion AMpliSeq-based typing method of Toxoplasma gondii reveals aN ExCELLENT typing resolution among European type II straiNs
Popis výsledku v původním jazyce
Toxoplasma gondii is a protozoan parasite with a largely clonal population structure in Europe and North America (Howe and Sibley 1995). The clonal lineage type II prevails in Europe (Fernández-Escobar et al. 2022, Herrmann et al. 2010, Jokelainen et al. 2018, Shwab et al. 2014). A genotyping method, based on 15 microsatellite regions (Ajzenberg et al. 2010), represents the reference standard. By microsatellite genotyping it is possible to differentiate clonal lineages of T. gondii and it is also possible to discriminate different type II-isolates. In the present study, it was our aim to establish a next-generation sequencing (NGS)-based typing method with a high typing resolution which is sufficient to differentiate within the clonal lineage type II, to trace back infection sources and to monitor for exotic or recombinant T. gondii strains.
Název v anglickém jazyce
A novel Ion AMpliSeq-based typing method of Toxoplasma gondii reveals aN ExCELLENT typing resolution among European type II straiNs
Popis výsledku anglicky
Toxoplasma gondii is a protozoan parasite with a largely clonal population structure in Europe and North America (Howe and Sibley 1995). The clonal lineage type II prevails in Europe (Fernández-Escobar et al. 2022, Herrmann et al. 2010, Jokelainen et al. 2018, Shwab et al. 2014). A genotyping method, based on 15 microsatellite regions (Ajzenberg et al. 2010), represents the reference standard. By microsatellite genotyping it is possible to differentiate clonal lineages of T. gondii and it is also possible to discriminate different type II-isolates. In the present study, it was our aim to establish a next-generation sequencing (NGS)-based typing method with a high typing resolution which is sufficient to differentiate within the clonal lineage type II, to trace back infection sources and to monitor for exotic or recombinant T. gondii strains.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
—
OECD FORD obor
40301 - Veterinary science
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
N - Vyzkumna aktivita podporovana z neverejnych zdroju
Ostatní
Rok uplatnění
2022
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Tagung der DVG-Fachgruppe Parasitologie und parasitäre Krankheiten 2022
ISBN
978-3-86345-624-5
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
117-120
Název nakladatele
DVG Service GmbH
Místo vydání
Berlín
Místo konání akce
Berlin
Datum konání akce
23. 5. 2022
Typ akce podle státní příslušnosti
EUR - Evropská akce
Kód UT WoS článku
—