Comparison of the efficiency of real-time RT-PCR and RT-PCR on field isolates of causative agent of viral haemorrhagic septicaemia from the Czech Republic
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F15%3A43873980" target="_blank" >RIV/62157124:16270/15:43873980 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
slovinština
Název v původním jazyce
Porovnanie efektivity identifikácie pôvodcu vírusovej hemoragickej septikémie pomocou real-time RT-PCR a RT-PCR na terénnych izolátoch z Českej republiky
Popis výsledku v původním jazyce
V našom príspevku popisujeme zavedenie metódy real-time RT-PCR pre identifikáciu vírusu vírusovej hemoragickej septikémie (VHSV). Zároveň s overením senzitivity a špecificity vlastnosti tejto metódy porovnávame so v súčasnosti používanými diagnostickýmimetódami: konvenčnou RT-PCR a kultiváciou na bunkovej kultúre. Real-time RT-PCR, ktorej primery a sondy sú cielené na vysoko konzervatívny úsek génu pre virálny nukleoproteín, sa oproti tradične používaným metódam vyznačuje nižšou časovou a technickou náročnosťou. V rámci našej štúdie sme preukázali vyššiu citlivosť real-time RT-PCR v porovnaní s konvenčnou RT-PCR, kedy real-time PCR detekovala vírus vo vzorkách s riedením 10-6, zatiaľ čo detekčný limit pre konvenčnú RT-PCR dosiahol maximálne 10-5. Preukázali sme citlivosť metódy na spektrum izolátov VHSV vyskytujúcich sa na území Českej republiky, pomocou analýzy 25 unikátnych izolátov vírusu kultivovaných z tuzemských ohnísk VHS z obdobia 1996 - 2015. Taktiež sme vylúčili krížovú reak
Název v anglickém jazyce
Comparison of the efficiency of real-time RT-PCR and RT-PCR on field isolates of causative agent of viral haemorrhagic septicaemia from the Czech Republic
Popis výsledku anglicky
In our project we introduced the real-time RT-PCR method for detection of viral haemorrhagic septicaemia virus to our laboratory. We tested the sensitivity of the method on panel of 25 field isolates of the pathogen from Czech Republic. The specificity of the method was tested on 8 isolates of genetically similar infectious haematopoietic necrosis virus. Real-time RT-PCR properties were then compared with the conventional RT-PCR method.
Klasifikace
Druh
D - Stať ve sborníku
CEP obor
GJ - Choroby a škůdci zvířat, veterinární medicina
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
S - Specificky vyzkum na vysokych skolach
Ostatní
Rok uplatnění
2015
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název statě ve sborníku
Sborník fakultní studentské vědecké konference IGA VFU Brno 2015
ISBN
978-80-7305-766-4
ISSN
—
e-ISSN
—
Počet stran výsledku
4
Strana od-do
117-120
Název nakladatele
Veterinární a farmaceutická univerzita Brno
Místo vydání
Brno
Místo konání akce
Brno
Datum konání akce
10. 12. 2015
Typ akce podle státní příslušnosti
CST - Celostátní akce
Kód UT WoS článku
—