Introduction of Real-Time RT-PCR Assay for Detection of Viral Haemorrhagic Septicaemia Virus in Salmonids and Its Comparison with Methods Currently Used in Czech Republic

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F16%3A43874597" target="_blank" >RIV/62157124:16270/16:43874597 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

slovinština

Název v původním jazyce

Zavedenie real-time RT-PCR pre diagnostiku pôvodcu vírusovej hemoragickej septikémie u lososovitých rýb a jej porovnanie s metódami používanými v Českej republike

Popis výsledku v původním jazyce

Vírusová hemoragická septikémia (VHS) je jedným z najzávažnejších vírusových ochorení rýb na území Českej republiky. Monitoring pôvodcu predstavuje, spolu s likvidáciou ohnísk ochorenia, jedinú metódu ochrany chovov lososovitých rýb v ČR. V súčasnosti používané metódy diagnostiky vírusu VHS majú nevýhody v podobe časovej (izolácia na bunkovej kultúre) alebo technickej (konvenčná RT-PCR) náročnosti. Nami zavedená metóda real-time RT-PCR obchádza spomínané nedostatky a zároveň vykazuje vyšší prah citlivosti. Metódou real-time RT-PCR bol testovaný panel 24 tuzemských izolátov VHSV kultivovaných na bunečnej línií RTG, ako aj panel 8 izolátov geneticky príbuzného vírusu infekčnej hemoragickej septikémie (IHNV), pre overenie špecificity metódy. Taktiež bola porovnávaná citlivosť metód real-time RT-PCR, konvenčnej RT-PCR a izolácie na bunkovej kultúre na rôzne koncentrácie vírusu. V poslednej fáze sme testovali terénne vzorky z tkanív rýb podozrivých alebo pozitívnych na prítomnosť vírusu VHS.

Název v anglickém jazyce

Introduction of Real-Time RT-PCR Assay for Detection of Viral Haemorrhagic Septicaemia Virus in Salmonids and Its Comparison with Methods Currently Used in Czech Republic

Popis výsledku anglicky

In our study we introduced a one-step real-time RT-PCR assay for detection of Viral haemorrhagic septicaemia virus in tissue samples from fish. We also tested the sensitivity of the assay and compared it to methods currently used for diagnostic of the virus in Czech Republic, namely the conventional end-point RT-PCR and cell culture isolation. The specificity of the assay was also tested, via analysis of several isolates of genetically similar Infectious hematopoietic necrosis virus.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

GL - Rybářství

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2016

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

XVIII. Konference mladých vědeckých pracovníků s mezinárodní účastí: sborník příspěvků

ISBN

978-80-7305-772-5

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

3

Strana od-do

110-112

Název nakladatele

Veterinární a farmaceutická univerzita Brno

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

25. 5. 2016

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—