Multiplexní detekce a identifikace významných druhů klostridií a genů zodpovědných za produkci jejich toxinů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F24%3A43881214" target="_blank" >RIV/62157124:16270/24:43881214 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://hygiena-alimentorum.uvlf.sk/wp-content/uploads/zborniky/XLIV_RZPaPP.pdf" target="_blank" >https://hygiena-alimentorum.uvlf.sk/wp-content/uploads/zborniky/XLIV_RZPaPP.pdf</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Multiplexní detekce a identifikace významných druhů klostridií a genů zodpovědných za produkci jejich toxinů

Popis výsledku v původním jazyce

Klostridie jsou polyfyletickou třídou anaerobů, které jsou plodnými producenty toxinů. V této studii popisujeme multiplexní metodu qPCR pro detekci důležitých patogenů úzce souvisejících s alimentárními chorobami – Clostridium perfringens, Clostridioides difficile, Clostridium botulinum a genů odpovědných za produkci jejich hlavních toxinů (cpa, cpb, cpe, tcdA, tcdB , cdt, bontA, bontB, bontE a bontF). Byl stanoven limit detekce, diagnostická senzitivita a specificita. V rámci multiplexní qPCR nedošlo ke křížové detekci druhů a necílové bakterie nevytvářely falešně pozitivní výsledky. Jedinečnost systému spočívá v multiplexování různých vzorků, ale také ve vysoké citlivosti umožňující detekovat 10 kopií DNA na reakci nebo i méně. Metoda multiplexní qPCR nabízí rychlou, jednoduchou a přesnou identifikaci významných patogenů. Mohla by být použita při stanovení bezpečnosti potravin, v klinické diagnostice a pro sledování patogenů v epidemiologických studiích.

Název v anglickém jazyce

Multiplex detection and identification of important Clostridia species and genes responsible for the toxins production

Popis výsledku anglicky

Clostridia are a polyphyletic class of anaerobes that are prolific toxin producers. In this study, we describe a multiplex qPCR method for the detection of important pathogens closely related to foodborne diseases – Clostridium perfringens, Clostridioides difficile, Clostridium botulinum and genes responsible for the production of their major toxins (cpa, cpb, cpe, tcdA, tcdB, cdt, bontA, bontB, bontE and bontF). The limit of detection, diagnostic sensitivity, and specificity were determined. There was no cross-detection of species within the multiplex qPCR, and non-target bacteria were not creating falsely positive results. The system&apos;s uniqueness lies in the multiplexing of different samples, but also in its high sensitivity making it possible to detect 10 DNA copies per reaction or even less. The multiplex qPCR method offers quick, simple, andprecise identification of significant pathogens. It could be used in food safety investigations, clinical diagnosis, and surveillance of the spreading determinants of pathogens in epidemiological studies.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

40301 - Veterinary science

Projekt

<a href="/cs/project/QK22010086" target="_blank" >QK22010086: Multiplexní detekce a identifikace genů zodpovědných za antimikrobiální rezistenci a produkci toxinů u významných bakteriálních agens v potravinách</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Hygiena Alimentorum XLIV.: Mäso a mäsové výrobky

ISBN

978-80-8077-822-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

469-476

Název nakladatele

Univerzita veterinárskeho lekárstva a farmácie v Košiciach

Místo vydání

Košice

Místo konání akce

Štrbské Pleso

Datum konání akce

15. 5. 2024

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—