Escherichia coli ST131 virotyp E: komplexní genomická analýza vysoce klonální multirezistentní linie a jejího šíření v prostředí

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62157124%3A16270%2F24%3A43881618" target="_blank" >RIV/62157124:16270/24:43881618 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/62157124:16810/24:43881618

Výsledek na webu

<a href="https://www.vetuni.cz/o-univerzite/vyzkum-vyvoj-rozvoj/vyzkumne-projekty/iga-vfu-brno" target="_blank" >https://www.vetuni.cz/o-univerzite/vyzkum-vyvoj-rozvoj/vyzkumne-projekty/iga-vfu-brno</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Escherichia coli ST131 virotyp E: komplexní genomická analýza vysoce klonální multirezistentní linie a jejího šíření v prostředí

Popis výsledku v původním jazyce

Neustále se zvyšující antibiotická rezistence bakterií představuje rozsáhlý problém nejen v oblasti humánní a veterinární medicíny, ale také v případě volně žijících zvířat a životního prostředí. Gramnegativní bakterie, včetně Escherichia coli, představují rozsáhlou skupinu rezistentních mikroorganismů kolonizujících různá prostředí. E. coli sekvenční typ (ST) 131 patří mezi celosvětově rozšířené klonální linie multirezistentních kmenů. Tato linie je z velké části zodpovědná za vznik nozokomiálních nákaz, ale také za infekce drůbeže a domácích zvířat. Vysoká míra výskytu konjugativních plazmidů zvyšuje pravděpodobnost šíření genů rezistence i virulence, a vede k tomu, že je v dnešní době tento ST hlavní linií zodpovědnou za šíření širokospektrých beta-laktamáz.Mimo běžné fylogenetické skupiny A, B, C0, C1 a C2 je možné ST131 rozdělovat do virotypů A, B, C, D, E a F charakterizovaných vybranými faktory virulence. V našem projektu se zaměřujeme na virotyp E, který je asociován s fylogenetickou skupinou C2. Skupina virotypu E se vyznačuje poměrně vysokou klonalitou, a to jak mezi izoláty získanými z jednoho zdroje, tak mezi izoláty pocházejícími z různých prostředí. U izolátů nalezených u pacientů s infekcemi močových cest se také často vyskytuje genomický ostrov pheU, na kterém se obvykle nachází gen cnf1 zodpovědný za produkci cytotoxického nekrotizujícího faktoru spolu s operonem hlyCABD zapříčiňujícího produkci toxinů ze skupiny hemolysinů. U tohoto genomického ostrova je často diskutován přenos mezi různými kmeny E. coli za pomoci konjugativních IncF plazmidů. Objevena byla také přítomnost arc operonu pro utilizaci argininu ohraničeného inzerčními sekvencemi, díky nimž je tento operon podobně jako výše zmíněné geny nejčastěji přenášen na konjugativních IncF plazmidech.

Název v anglickém jazyce

Escherichia coli ST131 virotype E: comprehensive genomic analysis of a highly clonal multidrug-resistant lineage and its spread in the environment

Popis výsledku anglicky

The ever-increasing antibiotic resistance of bacteria is a major problem not only in human and veterinary medicine, but also in wildlife and the environment. Gram-negative bacteria, including Escherichia coli, represent a large group of resistant microorganisms colonizing various environments. E. coli sequence type (ST) 131 is among the most widespread clonal lineages of multidrug-resistant strains worldwide. This lineage is largely responsible for the emergence of nosocomial infections, but also for infections of poultry and domestic animals. The high incidence of conjugative plasmids increases the likelihood of the spread of resistance and virulence genes, and leads to the fact that this ST is currently the main lineage responsible for the spread of extended-spectrum beta-lactamases.In addition to the common phylogenetic groups A, B, C0, C1 and C2, ST131 can be divided into virotypes A, B, C, D, E and F characterized by selected virulence factors. In our project, we focus on virotype E, which is associated with phylogenetic group C2. The virotype E group is characterized by relatively high clonality, both among isolates obtained from the same source and among isolates originating from different environments. In isolates found in patients with urinary tract infections, the genomic island pheU is also often found, which usually contains the cnf1 gene responsible for the production of cytotoxic necrotizing factor together with the hlyCABD operon causing the production of toxins from the hemolysin group. The transfer of this genomic island between different E. coli strains using conjugative IncF plasmids is often discussed. The presence of the arc operon for arginine utilization bordered by insertion sequences was also discovered, thanks to which this operon, like the above-mentioned genes, is most often transferred on conjugative IncF plasmids.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

—

OECD FORD obor

10606 - Microbiology

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach<br>I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2024

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

SBORNÍK PŘÍSPĚVKŮ z výsledků řešení projektů IGA VETUNI Brno 2024 financovaných z prostředků účelové podpory na specifický vysokoškolský výzkum MŠMT na rok 2024

ISBN

978-80-7305-974-3

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

66-69

Název nakladatele

Veterinární univerzita Brno

Místo vydání

Brno

Místo konání akce

Brno

Datum konání akce

11. 12. 2024

Typ akce podle státní příslušnosti

CST - Celostátní akce

Kód UT WoS článku

—