Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

COMPLEXITY and INFORMATION-BASED ANALYSIS of the VARIATIONS of the SARS-COV-2 GENOME in the UNITED STATES of AMERICA (USA)

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F62690094%3A18450%2F20%3A50017287" target="_blank" >RIV/62690094:18450/20:50017287 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://www.worldscientific.com/doi/abs/10.1142/S0218348X21500237" target="_blank" >https://www.worldscientific.com/doi/abs/10.1142/S0218348X21500237</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1142/S0218348X21500237" target="_blank" >10.1142/S0218348X21500237</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    COMPLEXITY and INFORMATION-BASED ANALYSIS of the VARIATIONS of the SARS-COV-2 GENOME in the UNITED STATES of AMERICA (USA)

  • Popis výsledku v původním jazyce

    SARS-CoV-2 is a deadly virus that has affected human life since late 2019. Between all the countries that have reported the cases of patients with SARS-CoV-2 disease (COVID-19), the United States of America has the highest number of infected people and mortality rate. Since different states in the USA reported different numbers of patients and also death cases, analyzing the difference of SARS-CoV-2 between these states has great importance. Since the generated RNA walk from the SARS-CoV-2 genome includes complex random fluctuations that also contain information, in this study, we employ the complexity and information theories to investigate the variations of SARS-CoV-2 genome between different states in the USA for the first time. The results of our analysis showed that the fractal dimension and Shannon entropy of genome walk significantly change between different states. Based on these results, we can conclude that the SARS-CoV-2 genomic structure significantly changes between different states, which is resulted from the virus evolution. Therefore, developing a vaccine for SARS-CoV-2 is very challenging since it should be able to fight various structures of the virus in different states. © 2020

  • Název v anglickém jazyce

    COMPLEXITY and INFORMATION-BASED ANALYSIS of the VARIATIONS of the SARS-COV-2 GENOME in the UNITED STATES of AMERICA (USA)

  • Popis výsledku anglicky

    SARS-CoV-2 is a deadly virus that has affected human life since late 2019. Between all the countries that have reported the cases of patients with SARS-CoV-2 disease (COVID-19), the United States of America has the highest number of infected people and mortality rate. Since different states in the USA reported different numbers of patients and also death cases, analyzing the difference of SARS-CoV-2 between these states has great importance. Since the generated RNA walk from the SARS-CoV-2 genome includes complex random fluctuations that also contain information, in this study, we employ the complexity and information theories to investigate the variations of SARS-CoV-2 genome between different states in the USA for the first time. The results of our analysis showed that the fractal dimension and Shannon entropy of genome walk significantly change between different states. Based on these results, we can conclude that the SARS-CoV-2 genomic structure significantly changes between different states, which is resulted from the virus evolution. Therefore, developing a vaccine for SARS-CoV-2 is very challenging since it should be able to fight various structures of the virus in different states. © 2020

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10102 - Applied mathematics

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Fractals

  • ISSN

    0218-348X

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    28

  • Číslo periodika v rámci svazku

    7

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    10

  • Strana od-do

    "Article number 2150023"

  • Kód UT WoS článku

    000601256800028

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85095426662