Intertumoral Heterogeneity within Medulloblastoma Subgroups

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F65269705%3A_____%2F17%3A00067531" target="_blank" >RIV/65269705:_____/17:00067531 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/00216224:14110/17:00098842

Výsledek na webu

<a href="https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1535610817302015?via%3Dihub" target="_blank" >https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S1535610817302015?via%3Dihub</a>

DOI - Digital Object Identifier

<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.ccell.2017.05.005" target="_blank" >10.1016/j.ccell.2017.05.005</a>

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Intertumoral Heterogeneity within Medulloblastoma Subgroups

Popis výsledku v původním jazyce

While molecular subgrouping has revolutionized medulloblastoma classification, the extent of heterogeneity within subgroups is unknown. Similarity network fusion (SNF) applied to genome-wide DNA methylation and gene expression data across 763 primary samples identifies very homogeneous clusters of patients, supporting the presence of medulloblastoma subtypes. After integration of somatic copy-number alterations, and clinical features specific to each cluster, we identify 12 different subtypes of medulloblastoma. Integrative analysis using SNF further delineates group 3 from group 4 medulloblastoma, which is not as readily apparent through analyses of individual data types. Two clear subtypes of infants with Sonic Hedgehog medulloblastoma with disparate outcomes and biology are identified. Medulloblastoma subtypes identified through integrative clustering have important implications for stratification of future clinical trials.

Název v anglickém jazyce

Intertumoral Heterogeneity within Medulloblastoma Subgroups

Popis výsledku anglicky

While molecular subgrouping has revolutionized medulloblastoma classification, the extent of heterogeneity within subgroups is unknown. Similarity network fusion (SNF) applied to genome-wide DNA methylation and gene expression data across 763 primary samples identifies very homogeneous clusters of patients, supporting the presence of medulloblastoma subtypes. After integration of somatic copy-number alterations, and clinical features specific to each cluster, we identify 12 different subtypes of medulloblastoma. Integrative analysis using SNF further delineates group 3 from group 4 medulloblastoma, which is not as readily apparent through analyses of individual data types. Two clear subtypes of infants with Sonic Hedgehog medulloblastoma with disparate outcomes and biology are identified. Medulloblastoma subtypes identified through integrative clustering have important implications for stratification of future clinical trials.

Druh

J_imp - Článek v periodiku v databázi Web of Science

CEP obor

—

OECD FORD obor

30204 - Oncology

Projekt

<a href="/cs/project/EE2.3.20.0183" target="_blank" >EE2.3.20.0183: Centrum experimentální biomedicíny</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2017

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Cancer Cell

ISSN

1535-6108

e-ISSN

—

Svazek periodika

31

Číslo periodika v rámci svazku

6

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

24

Strana od-do

737-"+"

Kód UT WoS článku

000403074800005

EID výsledku v databázi Scopus

—