MikroRNA v mozkomíšním moku jako diagnostické markery mozkových nádorů

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F65269705%3A_____%2F19%3A00071786" target="_blank" >RIV/65269705:_____/19:00071786 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

<a href="https://www.icsbs.cz/aktuality/konference/88-biologicke-dny-2019.html" target="_blank" >https://www.icsbs.cz/aktuality/konference/88-biologicke-dny-2019.html</a>

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

MikroRNA v mozkomíšním moku jako diagnostické markery mozkových nádorů

Popis výsledku v původním jazyce

Primární mozkové nádory a mozkové metastázy tvoří morfologicky a prognosticky značně různorodou skupinu nádorových onemocnění, jejichž incidence stále roste. Také terapie se u jednotlivých typů nádorů liší, proto je správné a včasné určení diagnózy pro pacienty klíčové. Současné diagnostické přístupy jsou však limitovány lokalizací a heterogenitou nádorů. Mozkomíšní mok (CSF), jež protéká celou centrální nervovou soustavu (CNS) a dostává se tak do kontaktu s možnou patologickou tkání, se jeví jako vhodný zdroj biologického materiálu pro hledání nových diagnostických biomarkerů. Takovými biomarkery by mohly být mikroRNA (miRNA), skupina krátkých nekódující RNA zapojených do patogeneze mnoha onemocnění včetně mozkových nádorů. Nicméně detekce a analýza miRNA v CSF nebyla doposud standardizována. Z tohoto důvodu byla v naší studii nejprve provedena optimalizace izolace RNA z CSF a následně vybrán nejvhodnější přístup jak pro globální expresní analýzu miRNA, tak pro kvantifikaci jednotlivých molekul. V optimalizovaném nastavení byla následně u 56 vzorků CSF odebraných od pacientů s mozkovými nádory (32 glioblastomů (GBM), 11 meningeomů (MNG), 13 mozkových metastáz (BM)) a u 19 vzorků CSF odebraných od pacientů s normotenzním hydrocefalem (NPH) bez prokázaného nádorového onemocnění provedena globální expresní analýza miRNA s využitím sekvenování nové generace (NGS); technologie NextSeq 500 (Illumina), příprava sekvenačních knihoven pomocí CleanTag Small RNA Library Preparation Kit (TriLink, Biotechnologies). Tato analýza odhalila postupně 22 (padj.&lt;0,0005), 12 (padj.&lt;0,01) a 35 (padj.&lt;0,005) miRNA s významně odlišnými hladinami u GBM, MNG a BM v porovnání s nenádorovými vzorky CSF. Následná validace vybraných miRNA na nezávislém souboru 117 vzorků CSF (41 GBM, 44 MNG, 12 BM a 20 NPH) pomocí technologie TaqMan Advanced miRNA Assays (ThermoFisher Scientific) umožnila vytvořit specifické diagnostické panely miRNA schopné klasifikovat pacienty s GBM (let-7b-5p a miR-196-5p: AUC = 0,8902, senzitivita: 80 %, specificita: 83 %) s MNG (miR-30e-5p, miR-140-5p a miR-196b-5p: AUC = 0,800, senzitivita: 80 %,specificita: 84 %) a s BM (miR-30e-5p a miR-140-5p: AUC = 0,8167, senzitivita: 65 %, specificita: 100 %). Naše výsledky tedy naznačují, že analýza miRNA v CSF by mohla vést ke zpřesnění současných histopatologických a zobrazovacích přístupů v diagnostice mozkových nádorů.

Název v anglickém jazyce

MicroRNA in cerebrospinal fluid as a diagnostic marker of brain tumors

Popis výsledku anglicky

Primary brain tumors and brain metastases form a morphologically and prognostically diverse group of cancers, the incidence of which is still increasing. Therapies also vary from tumor to tumor, so correct and timely diagnosis is crucial for patients. However, current diagnostic approaches are limited by the location and heterogeneity of tumors. Cerebrospinal fluid (CSF), which flows through the entire central nervous system (CNS) and thus comes into contact with possible pathological tissue, appears to be a suitable source of biological material for the search for new diagnostic biomarkers. Such biomarkers could be microRNAs (miRNAs), a group of short non-coding RNAs involved in the pathogenesis of many diseases, including brain tumors. However, detection and analysis of miRNAs in CSF has not yet been standardized. For this reason, in our study, the isolation of RNA from CSF was first optimized and then the most suitable approach was selected for both global miRNA expression analysis and quantification of individual molecules.

Druh

O - Ostatní výsledky

CEP obor

—

OECD FORD obor

30212 - Surgery

Projekt

<a href="/cs/project/NV18-03-00398" target="_blank" >NV18-03-00398: Rozšíření současných prognostických skórovacích systémů u mozkových metastáz o mikroRNA profilování s cílem individualizace pooperační péče</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2019

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů