BCOR gene allelic composition in patients with myelodysplastic syndrome
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F65269705%3A_____%2F21%3A00075183" target="_blank" >RIV/65269705:_____/21:00075183 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://www.prolekare.cz/casopisy/transfuze-hematologie-dnes/archiv-cisel/2021-supplementum-2" target="_blank" >https://www.prolekare.cz/casopisy/transfuze-hematologie-dnes/archiv-cisel/2021-supplementum-2</a>
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
slovinština
Název v původním jazyce
Alelická kompozícia génu BCOR u pacientov s myelodysplastickým syndrómom
Popis výsledku v původním jazyce
Gén BCOR kóduje korepresor proteínu BCL6 a funguje tiež ako korepresor transkripcie. Vzhľadom k polohe na chromozóme X vedú aberácie génu u mužov k čiastočnej či úplnej inaktivácii jeho funkcie. U žien sú k vyradeniu funkcie génu potrebné dva zásahy; mutácia jednej alely a delécia druhej alely. Aberácie v géne BCOR sa vyskytujú u rôznych hematologických malignít, vrátane AML, CMML či T-lymfómov. U myelodysplastického syndrómu (MDS) sa vyskytujú s frekvenciou < 5 % s preukázaným negatívnym vplyvom na celkové prežitie pacientov. Mutácie v géne BCOR boli vyšetrované z DNA leukocytov kostnej drene pacientov s MDS pomocou NGS (panel 37 génov, Archer VariantPlex(R) Core Myeloid Kit, ArcherDX). Knižnice boli sekvenované na prístroji NextSeq (Illumina). Časť pacientov bola paralelne vyšetrovaná metódou aCGH (SurePrint G3 Cancer CGH + SNP Microarray Kit 4x180K, Agilent). U 10 zo 94 vyšetrených sme identifikovali 11 mutácií génu BCOR (11 %). U všetkých 10 pacientov boli prítomné mutácie v ďalších testovaných génoch, najčastejšie sa jednalo o mutáciu génu RUNX1 (7/10). U 33/94 pacientov bolo prevedené vyšetrenie metódou aCGH vrátanie pacientov s mutáciou. U dvoch pacientiek s mutáciou v BCOR bola zistená strata heterozygotnosti (cnLOH) v oblasti daného génu pravdepodobne vedúca k inaktivácii funkcie oboch alel. U jedného mužského pacienta bez mutácie bola zistená submikroskopická delécia pokrývajúca BCOR. Výsledky našej práce sú prvými v rámci komplexnej genetickej analýzy génu BCOR u MDS. U pacientov s MDS sme v géne BCOR pozorovali viacero typov aberácií. U mužov boli detekované mutácie s pravdepodobným dopadom na jeho funkciu i delécia celého génu. U žien sme popri mutáciách nezaznamenali deléciu druhej alely iba cnLOH. Aberácie génu BCOR boli vo väčšine prípadov (8/11) spojené s vyšším percentom blastov až rýchlou progresiou do AML. Napriek tomu bol u väčšiny pacientov stanovený normálny karyotyp.
Název v anglickém jazyce
BCOR gene allelic composition in patients with myelodysplastic syndrome
Popis výsledku anglicky
The BCOR gene encodes a BCL6 protein corepressor and also functions as a transcriptional corepressor. Due to the position on the X chromosome lead to gene aberrations in men leading to partial or complete inactivation of its function. In women, two interventions are needed to eliminate gene function; mutation of one allele and deletion of the other allele. Aberrations in the BCOR gene occur in a variety of hematological malignancies, including AML, CMML and T-lymphomas. In myelodysplastic syndrome (MDS), they occur with a frequency of <5% with a proven negative impact on overall patient survival.
Klasifikace
Druh
O - Ostatní výsledky
CEP obor
—
OECD FORD obor
30205 - Hematology
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2021
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů