Automated Detection of Interphase and Metaphase Nuclei in the FISH Images

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985556%3A_____%2F12%3A00373700" target="_blank" >RIV/67985556:_____/12:00373700 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/68407700:21260/12:00198317

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Automated Detection of Interphase and Metaphase Nuclei in the FISH Images

Popis výsledku v původním jazyce

The fluorescence in-situ hybridization (FISH) belongs to the most common cytogenetic methods and is widely applied in routine clinical genetic diagnostics. We are paying attention to FISH analysis of chromosomal aneuploidies ? the deviations from chromosomal number. Such analysis is based on evaluation of up to several hundreds of microscopic images. Computer support for this process includes using methods of image processing and data mining. In this paper, we focus on the image processing part in moredetail: first, the properties of FISH images are reviewed, then, the processing flow is outlined. Our aim is to find the interphase and metaphase nuclei and the hybridization signals contained in the image. A simple method using the raw and central moments of detected objects as measures to distinguish between the two types of nuclei is proposed.

Název v anglickém jazyce

Automated Detection of Interphase and Metaphase Nuclei in the FISH Images

Popis výsledku anglicky

The fluorescence in-situ hybridization (FISH) belongs to the most common cytogenetic methods and is widely applied in routine clinical genetic diagnostics. We are paying attention to FISH analysis of chromosomal aneuploidies ? the deviations from chromosomal number. Such analysis is based on evaluation of up to several hundreds of microscopic images. Computer support for this process includes using methods of image processing and data mining. In this paper, we focus on the image processing part in moredetail: first, the properties of FISH images are reviewed, then, the processing flow is outlined. Our aim is to find the interphase and metaphase nuclei and the hybridization signals contained in the image. A simple method using the raw and central moments of detected objects as measures to distinguish between the two types of nuclei is proposed.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2012

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

BIOINFORMATICS 2012, Proceedings of the International Conference on Bioinformatics Models, Methods and Algorithms

ISBN

978-989-8425-90-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

347-350

Název nakladatele

SciTePress - Science and Technology Publications

Místo vydání

Algarve

Místo konání akce

Vilamoura, Algarve

Datum konání akce

1. 2. 2012

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—