Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Segmentation of Individual Cells in Phase Contrast Microscopy Images

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985556%3A_____%2F14%3A00435026" target="_blank" >RIV/67985556:_____/14:00435026 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Segmentation of Individual Cells in Phase Contrast Microscopy Images

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Phase contrast microscopy is widely used for live cell imaging. Automatic computer processing of phase-contrast images is complicated, particularly because of the halos that are present around the cells. We introduce a new algorithm able to segment individual cells by using the halos. The halos between cells are detected by thresholding and skeletonization, and gaps in the edges are filled in using Dijkstra?s algorithm. The result of the algorithm was compared with the results of manual segmentation performed by a human expert and evaluated on level of precision of individual cells? edges. The source code and test data, including the manual segmentation are made available to the public.

  • Název v anglickém jazyce

    Segmentation of Individual Cells in Phase Contrast Microscopy Images

  • Popis výsledku anglicky

    Phase contrast microscopy is widely used for live cell imaging. Automatic computer processing of phase-contrast images is complicated, particularly because of the halos that are present around the cells. We introduce a new algorithm able to segment individual cells by using the halos. The halos between cells are detected by thresholding and skeletonization, and gaps in the edges are filled in using Dijkstra?s algorithm. The result of the algorithm was compared with the results of manual segmentation performed by a human expert and evaluated on level of precision of individual cells? edges. The source code and test data, including the manual segmentation are made available to the public.

Klasifikace

  • Druh

    D - Stať ve sborníku

  • CEP obor

    JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/GA13-29225S" target="_blank" >GA13-29225S: Slepá dekonvoluce obrazu v limitních podmínkách</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název statě ve sborníku

    Proceedings of the 18th Conference on Medical Image Understanding and Analysis

  • ISBN

    1-901725-51-0

  • ISSN

  • e-ISSN

  • Počet stran výsledku

    6

  • Strana od-do

    185-190

  • Název nakladatele

    City University London

  • Místo vydání

    London

  • Místo konání akce

    London

  • Datum konání akce

    9. 7. 2014

  • Typ akce podle státní příslušnosti

    WRD - Celosvětová akce

  • Kód UT WoS článku