Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

GenEx Software library for object detection in genetical analysis evaluation

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985556%3A_____%2F14%3A00438032" target="_blank" >RIV/67985556:_____/14:00438032 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://zoi.utia.cas.cz/node/805" target="_blank" >http://zoi.utia.cas.cz/node/805</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    GenEx Software library for object detection in genetical analysis evaluation

  • Popis výsledku v původním jazyce

    This package contains GenEx software library for analysis of FISH microscopy image. The purpose of this library is to detect round cell nuclei in the DAPI channel and fluorescence signals contained therein and to evaluate their shape and intensity parameters. It can process arbitrary number of signal channels. Main purpose of the library is to take the input set of 2D images from wide-field fluorescence miscroscope, to detect objects contained in these images, to filter them using either a simple filteror a classifier. Finally, the parameters of the objects are provided in the form of a CSV file for further analysis. Simple graphical editor is included to provide expert input for object classification. The library has been coded in Java on top of theImageJ library and may be used either as an ImageJ plugin or as a Java package. The pilot application for this library has been in a diagnostics system for mosaic form of the Turner syndrom (chromosomal abnormality in which part of the X

  • Název v anglickém jazyce

    GenEx Software library for object detection in genetical analysis evaluation

  • Popis výsledku anglicky

    This package contains GenEx software library for analysis of FISH microscopy image. The purpose of this library is to detect round cell nuclei in the DAPI channel and fluorescence signals contained therein and to evaluate their shape and intensity parameters. It can process arbitrary number of signal channels. Main purpose of the library is to take the input set of 2D images from wide-field fluorescence miscroscope, to detect objects contained in these images, to filter them using either a simple filteror a classifier. Finally, the parameters of the objects are provided in the form of a CSV file for further analysis. Simple graphical editor is included to provide expert input for object classification. The library has been coded in Java on top of theImageJ library and may be used either as an ImageJ plugin or as a Java package. The pilot application for this library has been in a diagnostics system for mosaic form of the Turner syndrom (chromosomal abnormality in which part of the X

Klasifikace

  • Druh

    R - Software

  • CEP obor

    JC - Počítačový hardware a software

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/TA01010931" target="_blank" >TA01010931: Systém pro podporu vyhodnocování metody FISH</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2014

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Interní identifikační kód produktu

    ZOI-soft-0438032

  • Technické parametry

    This package contains GenEx software library for analysis of FISH microscopy image.

  • Ekonomické parametry

    The purpose of this library is to detect round cell nuclei in the DAPI channel and fluorescence signals contained therein and to evaluate their shape and intensity parameters.

  • IČO vlastníka výsledku

    67985556

  • Název vlastníka

    Ústav teorie informace a automatizace AV ČR, v.v