Korekce útlumu jasu s hloubkou datových souborů získaných konfokálním mikroskopem založená na deformaci histogramu

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985823%3A_____%2F05%3A00021202" target="_blank" >RIV/67985823:_____/05:00021202 - isvavai.cz</a>

Nalezeny alternativní kódy

RIV/68407700:21460/05:12109462

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Histogram warping based correction of the light attenuation with depth of data sets captured by a confocal microscope

Popis výsledku v původním jazyce

A confocal laser scanning microscope (CLSM) gives possibility to capture images from a biological specimen in different depths and obtain a stack of precisely registered fluorescent images, i.e. a 3D image. However, fluorescent image intensities from a CLSM suffer from light loss distortions. This effect causes problems in subsequent analysis of biological objects. Therefore, methods for compensation of the light attenuation with depth must be used. It is possible to solve this problem by a feedback-based tuning of the CLSM hardware during scanning, but in this paper we pay attention to post-processing methods and developed such one. It is a two step algorithm. In the first step the algorithm determines a standard histogram of the stack of images and in the second step histograms of individual images are warped according to this standard histogram. The algorithm results in more stable brightness and contrast of images through the stack

Název v anglickém jazyce

Histogram warping based correction of the light attenuation with depth of data sets captured by a confocal microscope

Popis výsledku anglicky

A confocal laser scanning microscope (CLSM) gives possibility to capture images from a biological specimen in different depths and obtain a stack of precisely registered fluorescent images, i.e. a 3D image. However, fluorescent image intensities from a CLSM suffer from light loss distortions. This effect causes problems in subsequent analysis of biological objects. Therefore, methods for compensation of the light attenuation with depth must be used. It is possible to solve this problem by a feedback-based tuning of the CLSM hardware during scanning, but in this paper we pay attention to post-processing methods and developed such one. It is a two step algorithm. In the first step the algorithm determines a standard histogram of the stack of images and in the second step histograms of individual images are warped according to this standard histogram. The algorithm results in more stable brightness and contrast of images through the stack

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

Proceedings of the Fifth IASTED International Conference on Visualization, Imaging and Image Processing

ISBN

0-88986-528-0

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

6

Strana od-do

12-17

Název nakladatele

ACTA Press

Místo vydání

Anaheim

Místo konání akce

Benidorm

Datum konání akce

7. 9. 2005

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—