Treept: program pro permutační testy konkordance mezi fylogenetickým stromem a fenetickými znaky, pro operační systém Plan 9

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985831%3A_____%2F08%3A00322669" target="_blank" >RIV/67985831:_____/08:00322669 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Treept: a program for permutation testing of concordance between phylogeny and the distribution of phenetic traits, ported to Plan 9 OS

Popis výsledku v původním jazyce

Treept is the freeware program for permutation testing concordance between phylogeny and the distribution of phenetic traits. Source code of treept is available. The program can analyse the quantitive and qualitative character data as well as the distance matrices. The phylogenic tree can be entered in usual bracketed format. The average distance between sister OTUs is calculated or read from a distance matrix and used as a measure of concordance which is tested in one-sided or two sided permutation tail test. The program can either generate all possible permutations of apical branches of the tree or the number of random permutation of tree to be generated can be choosen by a researcher. Plan 9 is a distributed operating system developed by researchersat Bell Labs (Lucent) to replace UNIX OS.

Název v anglickém jazyce

Treept: a program for permutation testing of concordance between phylogeny and the distribution of phenetic traits, ported to Plan 9 OS

Popis výsledku anglicky

Treept is the freeware program for permutation testing concordance between phylogeny and the distribution of phenetic traits. Source code of treept is available. The program can analyse the quantitive and qualitative character data as well as the distance matrices. The phylogenic tree can be entered in usual bracketed format. The average distance between sister OTUs is calculated or read from a distance matrix and used as a measure of concordance which is tested in one-sided or two sided permutation tail test. The program can either generate all possible permutations of apical branches of the tree or the number of random permutation of tree to be generated can be choosen by a researcher. Plan 9 is a distributed operating system developed by researchersat Bell Labs (Lucent) to replace UNIX OS.

Druh

R - Software

CEP obor

DB - Geologie a mineralogie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/IAA300130702" target="_blank" >IAA300130702: Růstové rytmy jako indikátor rotace Země a změn klimatu v geologické minulosti.</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

ARL 0322669

Technické parametry

1.812658 MB

Ekonomické parametry

—

IČO vlastníka výsledku

00216208

Název vlastníka

Přírodovědecká fakulta UK Praha