Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Deformation pattern in vibrating microtubule: Structural mechanics study based on an atomistic approach

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F67985882%3A_____%2F17%3A00484845" target="_blank" >RIV/67985882:_____/17:00484845 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/86652036:_____/17:00508136

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-04272-w" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-04272-w</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41598-017-04272-w" target="_blank" >10.1038/s41598-017-04272-w</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Deformation pattern in vibrating microtubule: Structural mechanics study based on an atomistic approach

  • Popis výsledku v původním jazyce

    The mechanical properties of microtubules are of great importance for understanding their biological function and for applications in artificial devices. Although microtubule mechanics has been extensively studied both theoretically and experimentally, the relation to its molecular structure is understood only partially. Here, we report on the structural analysis of microtubule vibration modes calculated by an atomistic approach. Molecular dynamics was applied to refine the atomic structure of a microtubule and a C-alpha elastic network model was analyzed for its normal modes. We mapped fluctuations and local deformations up to the level of individual aminoacid residues. The deformation is mode-shape dependent and principally different in alpha-tubulins and beta-tubulins. Parts of the tubulin dimer sequence responding specifically to longitudinal and radial stress are identified. We show that substantial strain within a microtubule is located both in the regions of contact between adjacent dimers and in the body of tubulins. Our results provide supportive evidence for the generally accepted assumption that the mechanics of microtubules, including its anisotropy, is determined by the bonds between tubulins

  • Název v anglickém jazyce

    Deformation pattern in vibrating microtubule: Structural mechanics study based on an atomistic approach

  • Popis výsledku anglicky

    The mechanical properties of microtubules are of great importance for understanding their biological function and for applications in artificial devices. Although microtubule mechanics has been extensively studied both theoretically and experimentally, the relation to its molecular structure is understood only partially. Here, we report on the structural analysis of microtubule vibration modes calculated by an atomistic approach. Molecular dynamics was applied to refine the atomic structure of a microtubule and a C-alpha elastic network model was analyzed for its normal modes. We mapped fluctuations and local deformations up to the level of individual aminoacid residues. The deformation is mode-shape dependent and principally different in alpha-tubulins and beta-tubulins. Parts of the tubulin dimer sequence responding specifically to longitudinal and radial stress are identified. We show that substantial strain within a microtubule is located both in the regions of contact between adjacent dimers and in the body of tubulins. Our results provide supportive evidence for the generally accepted assumption that the mechanics of microtubules, including its anisotropy, is determined by the bonds between tubulins

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10610 - Biophysics

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Scientific Reports

  • ISSN

    2045-2322

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    7

  • Číslo periodika v rámci svazku

    1

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    11

  • Strana od-do

  • Kód UT WoS článku

    000404037000013

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85021674172