Melting of cross-linked DNA V. Cross-linking effect caused by local stabilization of the double helix.

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F03%3A17033293" target="_blank" >RIV/68081707:_____/03:17033293 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Melting of cross-linked DNA V. Cross-linking effect caused by local stabilization of the double helix.

Popis výsledku v původním jazyce

The stabilization of DNA can be affected by all the types of chemical modifications of DNA (interstrand cross-links, intrastrand cross-links or monofunctional adducts) which give rise to a strong enough local stabilization of the double helix. Our calculation demonstrates that an increase in stability by 25 to 30 kcal in the free energy of a single base pair of the double helix is sufficient for conserving the helicity of this base pair and preventing strand separation after melting of ordinary base pairs. For the situation where there is more then one stabilized site in a DNA duplex, a lower stabilization per site is sufficient (18 - 20 kcal). A substantial increase in DNA stability was found in various experimental studies for some metal-based antitumor compounds. Stretches of GC pairs more than 25 bp in length inserted into poly(AT) DNA also exhibit properties of stabilizing interstrand cross-links.

Název v anglickém jazyce

Melting of cross-linked DNA V. Cross-linking effect caused by local stabilization of the double helix.

Popis výsledku anglicky

The stabilization of DNA can be affected by all the types of chemical modifications of DNA (interstrand cross-links, intrastrand cross-links or monofunctional adducts) which give rise to a strong enough local stabilization of the double helix. Our calculation demonstrates that an increase in stability by 25 to 30 kcal in the free energy of a single base pair of the double helix is sufficient for conserving the helicity of this base pair and preventing strand separation after melting of ordinary base pairs. For the situation where there is more then one stabilized site in a DNA duplex, a lower stabilization per site is sufficient (18 - 20 kcal). A substantial increase in DNA stability was found in various experimental studies for some metal-based antitumor compounds. Stretches of GC pairs more than 25 bp in length inserted into poly(AT) DNA also exhibit properties of stabilizing interstrand cross-links.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2003

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Journal of Biomolecular Structure and Dynamics

ISSN

0739-1102

e-ISSN

—

Svazek periodika

20

Číslo periodika v rámci svazku

4

Stát vydavatele periodika

CZ - Česká republika

Počet stran výsledku

13

Strana od-do

533-545

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—