Přesné interakční energie párů nukleových kyselin spojených vodíkovou vazbou
Popis výsledku
Páry bází spojené vodíkovými vazbami podstatně přispívají ke struktuře a stabilitě nukleových kyselin. Studie představuje referenční ab initio struktury a interakční energie vybraných párů bází v rozsahu vazebných energií od -5 do -47 kcal/mol. Molekulové struktury byly získány pomocí RI-MP2 metody s rozšířenou bází atomových orbitalů. Interakční energie byly vypočteny pomocí CBS extrapolace na úrovni RI-MP2.
Klíčová slova
hydrogen-bonded nucleic acid base pairsbinding enerigybasis-set calculations
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Accurate interaction energies of hydrogen-bonded nucleic acid base pairs
Popis výsledku v původním jazyce
Hydrogen-bonded nucleic acids base pairs substantially contribute to the structure and stability of nucleic acids. The study presents reference ab initio structures and interaction energies of selected base pairs with binding energies ranging from -5 to-47 kcal/mol. The molecular structures are obtained using the RI-MP2 method with extended cc-pVTZ basis set of atomic orbitals. The interaction energies are calculated using the Complete Basis Set (CBS) extrapolation at the RI-MP2 level.
Název v anglickém jazyce
Accurate interaction energies of hydrogen-bonded nucleic acid base pairs
Popis výsledku anglicky
Hydrogen-bonded nucleic acids base pairs substantially contribute to the structure and stability of nucleic acids. The study presents reference ab initio structures and interaction energies of selected base pairs with binding energies ranging from -5 to-47 kcal/mol. The molecular structures are obtained using the RI-MP2 method with extended cc-pVTZ basis set of atomic orbitals. The interaction energies are calculated using the Complete Basis Set (CBS) extrapolation at the RI-MP2 level.
Klasifikace
Druh
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
LN00A032: Struktura a dynamika komplexních molekulových systémů a biomolekul
Návaznosti
Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2004
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Journal of the American Chemical Society
ISSN
0002-7863
e-ISSN
—
Svazek periodika
126
Číslo periodika v rámci svazku
32
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
10
Strana od-do
10142-10151
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—
Druh výsledku
Jx - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP
BO - Biofyzika
Rok uplatnění
2004