Mapování konformačního B?A přechodu v plasmidové DNA

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F05%3A00001074" target="_blank" >RIV/68081707:_____/05:00001074 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Mapping the B-A conformational transition along plasmid DNA

Popis výsledku v původním jazyce

We illustrate properties of the method with the B-A conformational transition induced by ethanol in linearized pUC19 plasmid DNA. At various ethanol concentrations, the DNA was irradiated with UV light, transferred to a restriction endonuclease buffer and the irradiated DNA was cleaved by 17 restrictases. The irradiation damaged DNA and the damage blocked the restrictase cleavage. The amount of uncleaved, i.e. damaged, DNA depended on the concentration of ethanol in a characteristic S-shape way typicalof the cooperative B-A transition. The transition beginning and midpoint were determined for each restrictase. These data map the B-A transition along the whole polylinker of pUC19 DNA and six evenly distributed recognition sequences within the rest of the plasmid. The transition midpoints fell within the B-A transition region of the plasmid determined by CD spectroscopy. The present method complements the previous ones used to study the B-A transition.

Název v anglickém jazyce

Mapping the B-A conformational transition along plasmid DNA

Popis výsledku anglicky

We illustrate properties of the method with the B-A conformational transition induced by ethanol in linearized pUC19 plasmid DNA. At various ethanol concentrations, the DNA was irradiated with UV light, transferred to a restriction endonuclease buffer and the irradiated DNA was cleaved by 17 restrictases. The irradiation damaged DNA and the damage blocked the restrictase cleavage. The amount of uncleaved, i.e. damaged, DNA depended on the concentration of ethanol in a characteristic S-shape way typicalof the cooperative B-A transition. The transition beginning and midpoint were determined for each restrictase. These data map the B-A transition along the whole polylinker of pUC19 DNA and six evenly distributed recognition sequences within the rest of the plasmid. The transition midpoints fell within the B-A transition region of the plasmid determined by CD spectroscopy. The present method complements the previous ones used to study the B-A transition.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2005

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Nucleic Acids Research

ISSN

0305-1048

e-ISSN

—

Svazek periodika

33

Číslo periodika v rámci svazku

1 e5

Stát vydavatele periodika

GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

1-8

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—