Trombinový aptamer GGTTGGTGTGGTTGG tvoří bimolekulární guaninový tetraplex

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F06%3A00038935" target="_blank" >RIV/68081707:_____/06:00038935 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

The thrombin binding aptamer GGTTGGTGTGGTTGG forms a bimolecular guanine tetraplex

Popis výsledku v původním jazyce

In the literature, the thrombin binding aptamer GGTTGGTGTGGTTGG is generally taken as a prototype of an intramolecular guanine tetraplex of DNA. Our results, however, show that this notion is not true in aqueous solutions. This conclusion is based on a dependence of the CD spectra on aptamer concentration, migration of the aptamer in polyacrylamide gels, and the Ferguson analysis of the gel migration data. The presented data document that the aptamer forms a bimolecular tetraplex. We furthermore show that only an extension of the aptamer by a sequence containing further guanines, or an elongation of loop regions, causes that its tetraplex folding is intramolecular.

Název v anglickém jazyce

The thrombin binding aptamer GGTTGGTGTGGTTGG forms a bimolecular guanine tetraplex

Popis výsledku anglicky

In the literature, the thrombin binding aptamer GGTTGGTGTGGTTGG is generally taken as a prototype of an intramolecular guanine tetraplex of DNA. Our results, however, show that this notion is not true in aqueous solutions. This conclusion is based on a dependence of the CD spectra on aptamer concentration, migration of the aptamer in polyacrylamide gels, and the Ferguson analysis of the gel migration data. The presented data document that the aptamer forms a bimolecular tetraplex. We furthermore show that only an extension of the aptamer by a sequence containing further guanines, or an elongation of loop regions, causes that its tetraplex folding is intramolecular.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

BO - Biofyzika

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/IAA4004201" target="_blank" >IAA4004201: Tetraplexy DNA a jejich výskyt v lidském genomu</a><br>

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Biochemical and Biophysical Research Communications

ISSN

0006-291X

e-ISSN

—

Svazek periodika

344

Číslo periodika v rámci svazku

1

Stát vydavatele periodika

US - Spojené státy americké

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

50-54

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—