Elbow flexibility of the kt38 RNA kink-turn motif investigated by free-energy molecular dynamics simulations

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F09%3A00331241" target="_blank" >RIV/68081707:_____/09:00331241 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—

Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Elbow flexibility of the kt38 RNA kink-turn motif investigated by free-energy molecular dynamics simulations
Popis výsledku v původním jazyce
Umbrella-sampling molecular dynamics simulations were used to disrupt an A-minor interaction in the ribosomal kt38 turn and to calculate the associated free-energy change. The simulations revealed a coupled A-minor disruption and global opening of the K-turn motif, and allowed us to characterize several intermediate A-minor conformations.
Název v anglickém jazyce
Elbow flexibility of the kt38 RNA kink-turn motif investigated by free-energy molecular dynamics simulations
Popis výsledku anglicky
Umbrella-sampling molecular dynamics simulations were used to disrupt an A-minor interaction in the ribosomal kt38 turn and to calculate the associated free-energy change. The simulations revealed a coupled A-minor disruption and global opening of the K-turn motif, and allowed us to characterize several intermediate A-minor conformations.

Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—

Projekt
<a href="/cs/project/IAA400040802" target="_blank" >IAA400040802: Struktura, dynamika a reakční mechanismus katalytické RNA</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění
2009
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Podobné výsledky(10)