Explaining the varied glycosidic conformational, G-tract length and sequence preferences for anti-parallel G-quadruplexes
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F11%3A00365887" target="_blank" >RIV/68081707:_____/11:00365887 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkr031" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkr031</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/nar/gkr031" target="_blank" >10.1093/nar/gkr031</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Explaining the varied glycosidic conformational, G-tract length and sequence preferences for anti-parallel G-quadruplexes
Popis výsledku v původním jazyce
Guanine-rich DNA sequences tend to form four-stranded G-quadruplex structures. Characteristic glycosidic conformational patterns along the G-strands, such as the 50-syn-anti-syn-anti pattern observed with the Oxytricha nova telomeric G-quadruplexes, havebeen well documented. However, an explanation for these featured glycosidic patterns has not emerged. This work presents MD simulation and free energetic analyses for simplified two-quartet [d(GG)]4 models and suggests that the four base pair step patterns show quite different relative stabilities: syn-anti>anti-anti>anti-syn->syn-syn.
Název v anglickém jazyce
Explaining the varied glycosidic conformational, G-tract length and sequence preferences for anti-parallel G-quadruplexes
Popis výsledku anglicky
Guanine-rich DNA sequences tend to form four-stranded G-quadruplex structures. Characteristic glycosidic conformational patterns along the G-strands, such as the 50-syn-anti-syn-anti pattern observed with the Oxytricha nova telomeric G-quadruplexes, havebeen well documented. However, an explanation for these featured glycosidic patterns has not emerged. This work presents MD simulation and free energetic analyses for simplified two-quartet [d(GG)]4 models and suggests that the four base pair step patterns show quite different relative stabilities: syn-anti>anti-anti>anti-syn->syn-syn.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2011
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Nucleic Acids Research
ISSN
0305-1048
e-ISSN
—
Svazek periodika
39
Číslo periodika v rámci svazku
10
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
14
Strana od-do
4499-4512
Kód UT WoS článku
000291063500048
EID výsledku v databázi Scopus
—