Allium telomeres unmasked: the unusual telomeric sequence (CTCGGTTATGGG)(n) is synthesized by telomerase
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F16%3A00457672" target="_blank" >RIV/68081707:_____/16:00457672 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14740/16:00090824
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1111/tpj.13115" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1111/tpj.13115</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1111/tpj.13115" target="_blank" >10.1111/tpj.13115</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Allium telomeres unmasked: the unusual telomeric sequence (CTCGGTTATGGG)(n) is synthesized by telomerase
Popis výsledku v původním jazyce
Phylogenetic divergence in Asparagales plants is associated with switches in telomere sequences. The last switch occurred with divergence of the genus Allium (Amaryllidaceae) from the other Allioideae (formerly Alliaceae) genera, resulting in uncharacterized telomeres maintained by an unknown mechanism. To characterize the unknown Allium telomeres, we applied a combination of bioinformatic processing of transcriptomic and genomic data with standard approaches in telomere biology such as BAL31 sensitivity tests, terminal restriction fragment analysis, the telomere repeat amplification protocol (TRAP), and fluorescence insitu hybridization (FISH). Using these methods, we characterize the unusual telomeric sequence (CTCGGTTATGGG)(n) present in Allium species, demonstrate its synthesis by telomerase, and characterize the telomerase reverse transcriptase (TERT) subunit of Allium cepa.
Název v anglickém jazyce
Allium telomeres unmasked: the unusual telomeric sequence (CTCGGTTATGGG)(n) is synthesized by telomerase
Popis výsledku anglicky
Phylogenetic divergence in Asparagales plants is associated with switches in telomere sequences. The last switch occurred with divergence of the genus Allium (Amaryllidaceae) from the other Allioideae (formerly Alliaceae) genera, resulting in uncharacterized telomeres maintained by an unknown mechanism. To characterize the unknown Allium telomeres, we applied a combination of bioinformatic processing of transcriptomic and genomic data with standard approaches in telomere biology such as BAL31 sensitivity tests, terminal restriction fragment analysis, the telomere repeat amplification protocol (TRAP), and fluorescence insitu hybridization (FISH). Using these methods, we characterize the unusual telomeric sequence (CTCGGTTATGGG)(n) present in Allium species, demonstrate its synthesis by telomerase, and characterize the telomerase reverse transcriptase (TERT) subunit of Allium cepa.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
BO - Biofyzika
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Plant Journal
ISSN
0960-7412
e-ISSN
—
Svazek periodika
85
Číslo periodika v rámci svazku
3
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
11
Strana od-do
337-347
Kód UT WoS článku
000369857400001
EID výsledku v databázi Scopus
—