TE-greedy-nester: structure-based detection of LTR retrotransposons and their nesting

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081707%3A_____%2F20%3A00539921" target="_blank" >RIV/68081707:_____/20:00539921 - isvavai.cz</a>
Nalezeny alternativní kódy
RIV/00216224:14330/20:00118965
Výsledek na webu
<a href="https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/20/4991/5871348" target="_blank" >https://academic.oup.com/bioinformatics/article/36/20/4991/5871348</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1093/bioinformatics/btaa632" target="_blank" >10.1093/bioinformatics/btaa632</a>

Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
TE-greedy-nester: structure-based detection of LTR retrotransposons and their nesting
Popis výsledku v původním jazyce
Motivation: Transposable elements (TEs) in eukaryotes often get inserted into one another, forming sequences that become a complex mixture of full-length elements and their fragments. The reconstruction of full-length elements and the order in which they have been inserted is important for genome and transposon evolution studies. However, the accumulation of mutations and genome rearrangements over evolutionary time makes this process error-prone and decreases the efficiency of software aiming to recover all nested full-length TEs.
Název v anglickém jazyce
TE-greedy-nester: structure-based detection of LTR retrotransposons and their nesting
Popis výsledku anglicky
Motivation: Transposable elements (TEs) in eukaryotes often get inserted into one another, forming sequences that become a complex mixture of full-length elements and their fragments. The reconstruction of full-length elements and the order in which they have been inserted is important for genome and transposon evolution studies. However, the accumulation of mutations and genome rearrangements over evolutionary time makes this process error-prone and decreases the efficiency of software aiming to recover all nested full-length TEs.

Projekt
<a href="/cs/project/GA18-00258S" target="_blank" >GA18-00258S: Úloha transposonů v dynamice rostlinných genomů</a><br>
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika
Bioinformatics
ISSN
1367-4803
e-ISSN
—
Svazek periodika
36
Číslo periodika v rámci svazku
20
Stát vydavatele periodika
GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
4991-4999
Kód UT WoS článku
000605690100003
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85098877885

Podobné výsledky(10)