Application of high-resolution capillary array electrophoresis with automated fraction collection for GeneCalling analysis of the yeast genomic DNA.
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081715%3A_____%2F03%3A25033049" target="_blank" >RIV/68081715:_____/03:25033049 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Application of high-resolution capillary array electrophoresis with automated fraction collection for GeneCalling analysis of the yeast genomic DNA.
Popis výsledku v původním jazyce
Capillary array instrument was applied to transcript profiling of the yeast genomic DNA using GeneCaliing'' chemistry. The instrument integrated a 12-capillary array for DNA separation with a replaceable sieving matrix, laser-induced fluorescence detection and an automated microfraction collector. The DNA fractions, exiting the separation capillaries, were continuously deposited in a 1536-well collection plate made of agarose gel. DNA fragments recovered from selected fractions were cloned and then sequenced. Over 80% of theoretically predicted fragments could be recovered in the collected fractions, cloned and sequenced with an average redundancy of threefold. Excellent correlation of the experimentally obtained sequences with the theoretically predicted gene fragments demonstrated the suitability of capillary array electrophoresisfor micropreparative recovery of DNA fragments. This approach, useful especially for rapid DNA expression profiling of unknown genes for nonsequenced organi
Název v anglickém jazyce
Application of high-resolution capillary array electrophoresis with automated fraction collection for GeneCalling analysis of the yeast genomic DNA.
Popis výsledku anglicky
Capillary array instrument was applied to transcript profiling of the yeast genomic DNA using GeneCaliing'' chemistry. The instrument integrated a 12-capillary array for DNA separation with a replaceable sieving matrix, laser-induced fluorescence detection and an automated microfraction collector. The DNA fractions, exiting the separation capillaries, were continuously deposited in a 1536-well collection plate made of agarose gel. DNA fragments recovered from selected fractions were cloned and then sequenced. Over 80% of theoretically predicted fragments could be recovered in the collected fractions, cloned and sequenced with an average redundancy of threefold. Excellent correlation of the experimentally obtained sequences with the theoretically predicted gene fragments demonstrated the suitability of capillary array electrophoresisfor micropreparative recovery of DNA fragments. This approach, useful especially for rapid DNA expression profiling of unknown genes for nonsequenced organi
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
CB - Analytická chemie, separace
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2003
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Electrophoresis
ISSN
0173-0835
e-ISSN
—
Svazek periodika
24
Číslo periodika v rámci svazku
4
Stát vydavatele periodika
DE - Spolková republika Německo
Počet stran výsledku
9
Strana od-do
639-647
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—