Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Design and validation of an STR hexaplex assay for DNA profiling of grapevine cultivars

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081715%3A_____%2F16%3A00465488" target="_blank" >RIV/68081715:_____/16:00465488 - isvavai.cz</a>

  • Nalezeny alternativní kódy

    RIV/62156489:43510/16:43910458 RIV/61989592:15110/16:33161188 RIV/61989592:15310/16:33161188

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/elps.201600068" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1002/elps.201600068</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1002/elps.201600068" target="_blank" >10.1002/elps.201600068</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Design and validation of an STR hexaplex assay for DNA profiling of grapevine cultivars

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Although the analysis of length polymorphism at STR loci has become amethod of choice for grape cultivar identification, the standardization of methods for this purpose lags behind that of methods for DNA profiling in human and animal forensic genetics. The aim of this study was thus to design and validate a grapevine STR protocol with a practically useful level of multiplexing. Using free bioinformatics tools, published primer sequences, and nucleotide databases, we constructed and optimized a primer set for the simultaneous analysis of six STR loci (VVIi51, scu08vv, scu05vv, VVMD17, VrZAG47, and VrZAG83) by multiplex PCR and CE with laser-induced fluorescence, and tested it on 90 grape cultivars. The new protocol requires subnanogram quantities of the DNA template and enables automated, high-throughput genetic analysis with reasonable discriminatory power. As such, it represents a step toward further standardization of grape DNA profiling.

  • Název v anglickém jazyce

    Design and validation of an STR hexaplex assay for DNA profiling of grapevine cultivars

  • Popis výsledku anglicky

    Although the analysis of length polymorphism at STR loci has become amethod of choice for grape cultivar identification, the standardization of methods for this purpose lags behind that of methods for DNA profiling in human and animal forensic genetics. The aim of this study was thus to design and validate a grapevine STR protocol with a practically useful level of multiplexing. Using free bioinformatics tools, published primer sequences, and nucleotide databases, we constructed and optimized a primer set for the simultaneous analysis of six STR loci (VVIi51, scu08vv, scu05vv, VVMD17, VrZAG47, and VrZAG83) by multiplex PCR and CE with laser-induced fluorescence, and tested it on 90 grape cultivars. The new protocol requires subnanogram quantities of the DNA template and enables automated, high-throughput genetic analysis with reasonable discriminatory power. As such, it represents a step toward further standardization of grape DNA profiling.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

  • CEP obor

    CB - Analytická chemie, separace

  • OECD FORD obor

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2016

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Electrophoresis

  • ISSN

    0173-0835

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    37

  • Číslo periodika v rámci svazku

    23-24

  • Stát vydavatele periodika

    DE - Spolková republika Německo

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    3059-3067

  • Kód UT WoS článku

    000392421400003

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-84995791191