Duplikace, balancující selekce a trans-species evoluce vysvětlují vysoký stupeň polymorfismu genu DQA (MHC Class II) u hrabošů (Arvicolinae)

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081766%3A_____%2F06%3A00042520" target="_blank" >RIV/68081766:_____/06:00042520 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Duplication, balancing selection and trans-species evolution explain the high levels of polymorphism of the DQA MHC class II gene in voles (Arvicolinae)

Popis výsledku v původním jazyce

We described the structure and diversity of exon 2 of the MHC class II DQA gene in three species of voles (Arvicolinae) exhibiting regular multi-annual fluctuations of population density and analysed the processes leading to the observed MHC polymorphism. All exon 2 sequences translate to give unique amino acid sequences and positive selection was found to act very intensively on antigen binding sites. We documented the presence of recombination at vole DQA region but its importance in generating allelic polymorphism seems to be relatively limited. For the first time with rodents, we documented the duplication of the DQA gene in all three species with both copies being transcriptionally active.

Název v anglickém jazyce

Duplication, balancing selection and trans-species evolution explain the high levels of polymorphism of the DQA MHC class II gene in voles (Arvicolinae)

Popis výsledku anglicky

We described the structure and diversity of exon 2 of the MHC class II DQA gene in three species of voles (Arvicolinae) exhibiting regular multi-annual fluctuations of population density and analysed the processes leading to the observed MHC polymorphism. All exon 2 sequences translate to give unique amino acid sequences and positive selection was found to act very intensively on antigen binding sites. We documented the presence of recombination at vole DQA region but its importance in generating allelic polymorphism seems to be relatively limited. For the first time with rodents, we documented the duplication of the DQA gene in all three species with both copies being transcriptionally active.

Druh

J_x - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2006

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název periodika

Immunogenetics

ISSN

0093-7711

e-ISSN

—

Svazek periodika

58

Číslo periodika v rámci svazku

2-3

Stát vydavatele periodika

DE - Spolková republika Německo

Počet stran výsledku

12

Strana od-do

191-202

Kód UT WoS článku

—

EID výsledku v databázi Scopus

—