Development and characterization of multiplex panels of microsatellite markers for Syphacia obvelata, a parasite of the house mouse (Mus musculus), using a high throughput DNA sequencing approach
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68081766%3A_____%2F12%3A00379001" target="_blank" >RIV/68081766:_____/12:00379001 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.molbiopara.2012.07.002" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1016/j.molbiopara.2012.07.002</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.1016/j.molbiopara.2012.07.002" target="_blank" >10.1016/j.molbiopara.2012.07.002</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Development and characterization of multiplex panels of microsatellite markers for Syphacia obvelata, a parasite of the house mouse (Mus musculus), using a high throughput DNA sequencing approach
Popis výsledku v původním jazyce
Syphacia obvelata is a common gastro-intestinal parasitic nematode of the house mouse (Mus musculus), a prime model rodent species. Investigations of the genetic structure, variability of parasite populations and other biological aspects of this host?parasite system are limited due to the lack of genetic resources for S. obvelata. To fill this gap, we developed a set of microsatellite markers for S. obvelata, using a 454 pyrosequencing approach. We designed three multiplex panels allowing genotyping of10 polymorphic loci and scrutinized them on 42 samples from two different regions inhabited by two different house mouse subspecies (Mus musculus musculus and M. m. domesticus). The numbers of alleles ranged from 2 to 6 with mean observed heterozygosities 0.1476 and 0.2095 for domesticus and musculus worms, respectively. The described markers will facilitate further studies on population biology and co-evolution of this host?parasite system.
Název v anglickém jazyce
Development and characterization of multiplex panels of microsatellite markers for Syphacia obvelata, a parasite of the house mouse (Mus musculus), using a high throughput DNA sequencing approach
Popis výsledku anglicky
Syphacia obvelata is a common gastro-intestinal parasitic nematode of the house mouse (Mus musculus), a prime model rodent species. Investigations of the genetic structure, variability of parasite populations and other biological aspects of this host?parasite system are limited due to the lack of genetic resources for S. obvelata. To fill this gap, we developed a set of microsatellite markers for S. obvelata, using a 454 pyrosequencing approach. We designed three multiplex panels allowing genotyping of10 polymorphic loci and scrutinized them on 42 samples from two different regions inhabited by two different house mouse subspecies (Mus musculus musculus and M. m. domesticus). The numbers of alleles ranged from 2 to 6 with mean observed heterozygosities 0.1476 and 0.2095 for domesticus and musculus worms, respectively. The described markers will facilitate further studies on population biology and co-evolution of this host?parasite system.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EG - Zoologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2012
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
Molecular and Biochemical Parasitology
ISSN
0166-6851
e-ISSN
—
Svazek periodika
185
Číslo periodika v rámci svazku
2
Stát vydavatele periodika
NL - Nizozemsko
Počet stran výsledku
3
Strana od-do
154-156
Kód UT WoS článku
000310389700011
EID výsledku v databázi Scopus
—