Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Evidence for genetic association between chromosome 1q loci and predisposition to colorectal neoplasia.

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378041%3A_____%2F17%3A00476876" target="_blank" >RIV/68378041:_____/17:00476876 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/bjc.2017.240" target="_blank" >http://dx.doi.org/10.1038/bjc.2017.240</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/bjc.2017.240" target="_blank" >10.1038/bjc.2017.240</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Evidence for genetic association between chromosome 1q loci and predisposition to colorectal neoplasia.

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Background: A substantial fraction of familial colorectal cancer (CRC) and polyposis heritability remains unexplained. This study aimed to identify predisposing loci in patients with these disorders. nnMethods: Homozygosity mapping was performed using 222 563 SNPs in 302 index patients with various colorectal neoplasms and 3367 controls. Linkage analysis, exome and whole-genome sequencing were performed in a family affected by microsatellite stable CRCs. Candidate variants were genotyped in 10 554 cases and 21 480 controls. Gene expression was assessed at the mRNA and protein level. nnResults: Homozygosity mapping revealed a disease-associated region at 1q32.3 which was part of the linkage region 1q32.2-42.2 identified in the CRC family. This includes a region previously associated with risk of CRC. Sequencing identified the p.Asp1432Glu variant in the MIA3 gene ( known as TANGO1 or TANGO) and 472 additional rare, shared variants within the linkage region. In both cases and controls the population frequency was 0.02% for this MIA3 variant. The MIA3 mutant allele showed predominant mRNA expression in normal, cancer and precancerous tissues. Furthermore, immunohistochemistry revealed increased expression of MIA3 in adenomatous tissues. nnConclusions: Taken together, our two independent strategies associate genetic variations in chromosome 1q loci and predisposition to familial CRC and polyps, which warrants further investigation.

  • Název v anglickém jazyce

    Evidence for genetic association between chromosome 1q loci and predisposition to colorectal neoplasia.

  • Popis výsledku anglicky

    Background: A substantial fraction of familial colorectal cancer (CRC) and polyposis heritability remains unexplained. This study aimed to identify predisposing loci in patients with these disorders. nnMethods: Homozygosity mapping was performed using 222 563 SNPs in 302 index patients with various colorectal neoplasms and 3367 controls. Linkage analysis, exome and whole-genome sequencing were performed in a family affected by microsatellite stable CRCs. Candidate variants were genotyped in 10 554 cases and 21 480 controls. Gene expression was assessed at the mRNA and protein level. nnResults: Homozygosity mapping revealed a disease-associated region at 1q32.3 which was part of the linkage region 1q32.2-42.2 identified in the CRC family. This includes a region previously associated with risk of CRC. Sequencing identified the p.Asp1432Glu variant in the MIA3 gene ( known as TANGO1 or TANGO) and 472 additional rare, shared variants within the linkage region. In both cases and controls the population frequency was 0.02% for this MIA3 variant. The MIA3 mutant allele showed predominant mRNA expression in normal, cancer and precancerous tissues. Furthermore, immunohistochemistry revealed increased expression of MIA3 in adenomatous tissues. nnConclusions: Taken together, our two independent strategies associate genetic variations in chromosome 1q loci and predisposition to familial CRC and polyps, which warrants further investigation.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10608 - Biochemistry and molecular biology

Návaznosti výsledku

  • Projekt

    <a href="/cs/project/LD14050" target="_blank" >LD14050: Genetické a funkční determinanty nádorů tlustého střeva a konečníku a východiska k individualizované terapii</a><br>

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2017

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    British Journal of Cancer

  • ISSN

    0007-0920

  • e-ISSN

  • Svazek periodika

    117

  • Číslo periodika v rámci svazku

    8

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    1215-1223

  • Kód UT WoS článku

    000412648600015

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85028836164