Identifikace konservovaných alternativních a antisense transcriptů Pdcd2 genu
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F07%3A00082617" target="_blank" >RIV/68378050:_____/07:00082617 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
—
DOI - Digital Object Identifier
—
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Conserved alternative and antisense transcripts at the programmed cell death 2 locus
Popis výsledku v původním jazyce
The Pdcd2 gene on mouse Chr 17 was evaluated as a member of a highly conserved synteny, a candidate for an imprinted locus and for the Hst1 gene. New mouse transcripts were identified at this locus as alternative transcripts of the neighboring Tbp gene located mainly in the cell nucleus: an alternative Pdcd2 mRNA skipping the last 2 coding exons and 2 classes of antisense RNAs. Analogous alternative PDCD2 forms truncating the C-terminal domain were also detected in human and chicken. This finding suggests the biological importance of such truncated protein. The identified Tbp-alternative Pdcd2-antisense transcripts may interfere with the transcription of the Pdcd2 gene, as they are transcribed at a comparable level. The conservation of the Pdcd2/Tbp sense-antisense overlap in the mouse and chicken points out its biological relevance. Some cDNAs in databases labeled as noncoding thus may be incomplete alternative cDNAs of neighboring protein-coding genes.
Název v anglickém jazyce
Conserved alternative and antisense transcripts at the programmed cell death 2 locus
Popis výsledku anglicky
The Pdcd2 gene on mouse Chr 17 was evaluated as a member of a highly conserved synteny, a candidate for an imprinted locus and for the Hst1 gene. New mouse transcripts were identified at this locus as alternative transcripts of the neighboring Tbp gene located mainly in the cell nucleus: an alternative Pdcd2 mRNA skipping the last 2 coding exons and 2 classes of antisense RNAs. Analogous alternative PDCD2 forms truncating the C-terminal domain were also detected in human and chicken. This finding suggests the biological importance of such truncated protein. The identified Tbp-alternative Pdcd2-antisense transcripts may interfere with the transcription of the Pdcd2 gene, as they are transcribed at a comparable level. The conservation of the Pdcd2/Tbp sense-antisense overlap in the mouse and chicken points out its biological relevance. Some cDNAs in databases labeled as noncoding thus may be incomplete alternative cDNAs of neighboring protein-coding genes.
Klasifikace
Druh
J<sub>x</sub> - Nezařazeno - Článek v odborném periodiku (Jimp, Jsc a Jost)
CEP obor
EB - Genetika a molekulární biologie
OECD FORD obor
—
Návaznosti výsledku
Projekt
Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)
Ostatní
Rok uplatnění
2007
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
B M C Genomics
ISSN
1471-2164
e-ISSN
—
Svazek periodika
8
Číslo periodika v rámci svazku
-
Stát vydavatele periodika
US - Spojené státy americké
Počet stran výsledku
15
Strana od-do
20
Kód UT WoS článku
—
EID výsledku v databázi Scopus
—