Technologie selekce a přípravy aptameru pro hot-start PCR

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378050%3A_____%2F13%3A00427024" target="_blank" >RIV/68378050:_____/13:00427024 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

čeština

Název v původním jazyce

Technologie selekce a přípravy aptameru pro hot-start PCR

Popis výsledku v původním jazyce

Byl vyvinut nový postup metodiky získání aptameru proti Taq DNA polymeráze s cílem využít tento aptamer k tzv. hot-start PCR. Tento nový postup zahrnuje preabsorbci oligonukleotidových knihoven na irelevantních proteinech a dále kombinaci různých přístupů pro izolaci aptamerů. V opakovaných cyklech procedur SELEX, jak popsáno v odborné literatuře, se obvykle komponenty knihoven váží stále na tutéž imobilizovanou cílovou strukturu. Pokud některý z aptamerů knihovny reaguje s imobilizujícím podkladem nebosložkami, které blokují nespecifickou absorpci, dochází k jeho nabohacení společně s požadovanými aptamery. Tento problém je odstraněn u nové metody. Kvalita získaných aptamerů pro hot-start PCR byla ověřena na vývojovém pracovišti firmy Top-Bio s.r.o.a na Oddělení signální transdukce ÚMG AVČR. Výsledky ukázaly, že aptamery vhodné pro hot-start PCR mohou být reproducibilně získány s použitím nové strategie.

Název v anglickém jazyce

Technology for selection and preparation of aptamer for hot-start PCR polymerase

Popis výsledku anglicky

New method was developed for obtaining specific anti-Taq DNA polymerase aptamers suitable for hot-start PCR. The new method involves preabsorption of oligonucleotide libraries on the irrelevant proteins and combination of different approaches for isolation of aptamers. In repeated cycles of procedure SELEX, as described in scientific literature, the components of library bind repeatedly to the target structure immobilized on the same substrate. If any of the aptamers from library interacts with immobilizing matrix or components that block non-specific absorption, such aptamers are enriched together with the required aptamers. This problem is removed by the new method. Quality of the aptamers for hot-start PCR was verified in the developmental laboratory of Top-Bio s.r.o. and in the Department of Signal Transduction at IMG AVČR. The data showed that aptamers for hot-start PCR cam be reproducibly obtained using the new strategy.

Druh

Z_tech - Ověřená technologie

CEP obor

EB - Genetika a molekulární biologie

OECD FORD obor

—

Projekt

<a href="/cs/project/TA01010436" target="_blank" >TA01010436: Nové generace DNA aptamerů</a><br>

Návaznosti

I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Rok uplatnění

2013

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

-

Číselná identifikace

—

Technické parametry

Technologie selekce a přípravy aptameru pro hot-start PCR

Ekonomické parametry

předáno pro komerční využití firmě Top-Bio s.r.o., IČ 64578895

Kategorie aplik. výsledku dle nákladů

—

IČO vlastníka výsledku

68378050

Název vlastníka

Ústav molekulární genetiky AV ČR, v. v. i.

Stát vlastníka

CZ - Česká republika

Druh možnosti využití

P - Využití výsledku jiným subjektem je v některých případech možné bez nabytí licence

Požadavek na licenční poplatek

Z - Poskytovatel licence na výsledek nepožaduje v některých případech licenční poplatek

Adresa www stránky s výsledkem

—