Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Sensor histidine kinase NarQ activates via helical rotation, diagonal scissoring, and eventually piston-like shifts

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378271%3A_____%2F20%3A00563846" target="_blank" >RIV/68378271:_____/20:00563846 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://hdl.handle.net/11104/0335635" target="_blank" >https://hdl.handle.net/11104/0335635</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms21093110" target="_blank" >10.3390/ijms21093110</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Sensor histidine kinase NarQ activates via helical rotation, diagonal scissoring, and eventually piston-like shifts

  • Popis výsledku v původním jazyce

    Membrane-embedded sensor histidine kinases (HKs) and chemoreceptors are used ubiquitously by bacteria and archaea to percept the environment. Several mechanisms of transmembrane signal transduction in TCS receptors have been proposed, dubbed (swinging) piston, helical rotation, and diagonal scissoring. We extend our previous work on Escherichia coli nitrate/nitrite sensor kinase NarQ. We determined a crystallographic structure of the sensor-TM-HAMP fragment of the R50S mutant, which, unexpectedly, was found in a ligand-bound-like conformation, despite an inability to bind nitrate. Subsequently, we reanalyzed the structures of the ligand-free and ligand-bound NarQ and NarX sensor domains, and conducted extensive molecular dynamics simulations of ligand-free and ligand-bound wild type and mutated NarQ. Based on the data, we show that binding of nitrate to NarQ causes, first and foremost, helical rotation and diagonal scissoring of the α-helices at the core of the sensor domain.

  • Název v anglickém jazyce

    Sensor histidine kinase NarQ activates via helical rotation, diagonal scissoring, and eventually piston-like shifts

  • Popis výsledku anglicky

    Membrane-embedded sensor histidine kinases (HKs) and chemoreceptors are used ubiquitously by bacteria and archaea to percept the environment. Several mechanisms of transmembrane signal transduction in TCS receptors have been proposed, dubbed (swinging) piston, helical rotation, and diagonal scissoring. We extend our previous work on Escherichia coli nitrate/nitrite sensor kinase NarQ. We determined a crystallographic structure of the sensor-TM-HAMP fragment of the R50S mutant, which, unexpectedly, was found in a ligand-bound-like conformation, despite an inability to bind nitrate. Subsequently, we reanalyzed the structures of the ligand-free and ligand-bound NarQ and NarX sensor domains, and conducted extensive molecular dynamics simulations of ligand-free and ligand-bound wild type and mutated NarQ. Based on the data, we show that binding of nitrate to NarQ causes, first and foremost, helical rotation and diagonal scissoring of the α-helices at the core of the sensor domain.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10610 - Biophysics

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2020

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    International Journal of Molecular Sciences

  • ISSN

    1422-0067

  • e-ISSN

    1422-0067

  • Svazek periodika

    21

  • Číslo periodika v rámci svazku

    9

  • Stát vydavatele periodika

    CH - Švýcarská konfederace

  • Počet stran výsledku

    18

  • Strana od-do

    3110

  • Kód UT WoS článku

    000535581700081

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85083968633