Sensor histidine kinase NarQ activates via helical rotation, diagonal scissoring, and eventually piston-like shifts
Identifikátory výsledku
Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68378271%3A_____%2F20%3A00563846" target="_blank" >RIV/68378271:_____/20:00563846 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="https://hdl.handle.net/11104/0335635" target="_blank" >https://hdl.handle.net/11104/0335635</a>
DOI - Digital Object Identifier
<a href="http://dx.doi.org/10.3390/ijms21093110" target="_blank" >10.3390/ijms21093110</a>
Alternativní jazyky
Jazyk výsledku
angličtina
Název v původním jazyce
Sensor histidine kinase NarQ activates via helical rotation, diagonal scissoring, and eventually piston-like shifts
Popis výsledku v původním jazyce
Membrane-embedded sensor histidine kinases (HKs) and chemoreceptors are used ubiquitously by bacteria and archaea to percept the environment. Several mechanisms of transmembrane signal transduction in TCS receptors have been proposed, dubbed (swinging) piston, helical rotation, and diagonal scissoring. We extend our previous work on Escherichia coli nitrate/nitrite sensor kinase NarQ. We determined a crystallographic structure of the sensor-TM-HAMP fragment of the R50S mutant, which, unexpectedly, was found in a ligand-bound-like conformation, despite an inability to bind nitrate. Subsequently, we reanalyzed the structures of the ligand-free and ligand-bound NarQ and NarX sensor domains, and conducted extensive molecular dynamics simulations of ligand-free and ligand-bound wild type and mutated NarQ. Based on the data, we show that binding of nitrate to NarQ causes, first and foremost, helical rotation and diagonal scissoring of the α-helices at the core of the sensor domain.
Název v anglickém jazyce
Sensor histidine kinase NarQ activates via helical rotation, diagonal scissoring, and eventually piston-like shifts
Popis výsledku anglicky
Membrane-embedded sensor histidine kinases (HKs) and chemoreceptors are used ubiquitously by bacteria and archaea to percept the environment. Several mechanisms of transmembrane signal transduction in TCS receptors have been proposed, dubbed (swinging) piston, helical rotation, and diagonal scissoring. We extend our previous work on Escherichia coli nitrate/nitrite sensor kinase NarQ. We determined a crystallographic structure of the sensor-TM-HAMP fragment of the R50S mutant, which, unexpectedly, was found in a ligand-bound-like conformation, despite an inability to bind nitrate. Subsequently, we reanalyzed the structures of the ligand-free and ligand-bound NarQ and NarX sensor domains, and conducted extensive molecular dynamics simulations of ligand-free and ligand-bound wild type and mutated NarQ. Based on the data, we show that binding of nitrate to NarQ causes, first and foremost, helical rotation and diagonal scissoring of the α-helices at the core of the sensor domain.
Klasifikace
Druh
J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science
CEP obor
—
OECD FORD obor
10610 - Biophysics
Návaznosti výsledku
Projekt
—
Návaznosti
I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace
Ostatní
Rok uplatnění
2020
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů
Údaje specifické pro druh výsledku
Název periodika
International Journal of Molecular Sciences
ISSN
1422-0067
e-ISSN
1422-0067
Svazek periodika
21
Číslo periodika v rámci svazku
9
Stát vydavatele periodika
CH - Švýcarská konfederace
Počet stran výsledku
18
Strana od-do
3110
Kód UT WoS článku
000535581700081
EID výsledku v databázi Scopus
2-s2.0-85083968633