Cross-Genome Knowledge-Based Expression Data Fusion

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F09%3A00157248" target="_blank" >RIV/68407700:21230/09:00157248 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Cross-Genome Knowledge-Based Expression Data Fusion

Popis výsledku v původním jazyce

This paper presents the web tool XGENE.ORG which facilitates the integration of gene expression measurements with background genomic information, in particular the gene ontology and KEGG pathways. The novelty of the proposed data fusion is in the introduction of working units at different levels of generality acting as sample features, replacing the commonly used gene units, consequently al-lowing for cross-genome (multi-platform) expression data analysis. The integration of different microarray platforms contributes to the robustness of knowledge extracted when single-platform samples are rare and facilitates inference of biological knowledge not constrained to single organisms.

Název v anglickém jazyce

Cross-Genome Knowledge-Based Expression Data Fusion

Popis výsledku anglicky

This paper presents the web tool XGENE.ORG which facilitates the integration of gene expression measurements with background genomic information, in particular the gene ontology and KEGG pathways. The novelty of the proposed data fusion is in the introduction of working units at different levels of generality acting as sample features, replacing the commonly used gene units, consequently al-lowing for cross-genome (multi-platform) expression data analysis. The integration of different microarray platforms contributes to the robustness of knowledge extracted when single-platform samples are rare and facilitates inference of biological knowledge not constrained to single organisms.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění

2009

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

International Conference on Bioinformatics, Computational Biology, Genomics and Chemoinformatics (BCBGC-09)

ISBN

978-1-60651-009-4

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

8

Strana od-do

—

Název nakladatele

International Society for Research in Science and Technology (ISRST)

Místo vydání

Orlando

Místo konání akce

Orlando

Datum konání akce

10. 7. 2009

Typ akce podle státní příslušnosti

WRD - Celosvětová akce

Kód UT WoS článku

—