XGENE.ORG: Analýza multi-platformních dat genové exprese

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F08%3A03153081" target="_blank" >RIV/68407700:21230/08:03153081 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

XGENE.ORG: Cross-GENomE Cross-ORGanism expression data analysis

Popis výsledku v původním jazyce

XGENE.ORG is a free public tool for integrated analysis of gene expression data collected from diverse microarray platforms, possibly pertaining to various organism species with different genomes. The main features are: smooth search and import of expression samples from the NCBI GEO database of gene expression samples, automatic integration of heterogeneous platform/organism expression data, detection of markers (genes, pathways, fluxes, gene ontology terms) that best distinguish between user-suppliedsample classes, principal component analysis and classification models (decision trees, nearest neighbor) on top of the markers.

Název v anglickém jazyce

XGENE.ORG: Cross-GENomE Cross-ORGanism expression data analysis

Popis výsledku anglicky

XGENE.ORG is a free public tool for integrated analysis of gene expression data collected from diverse microarray platforms, possibly pertaining to various organism species with different genomes. The main features are: smooth search and import of expression samples from the NCBI GEO database of gene expression samples, automatic integration of heterogeneous platform/organism expression data, detection of markers (genes, pathways, fluxes, gene ontology terms) that best distinguish between user-suppliedsample classes, principal component analysis and classification models (decision trees, nearest neighbor) on top of the markers.

Druh

R - Software

CEP obor

JD - Využití počítačů, robotika a její aplikace

OECD FORD obor

—

Projekt

Výsledek vznikl pri realizaci vícero projektů. Více informací v záložce Projekty.

Návaznosti

P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)<br>Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2008

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Interní identifikační kód produktu

XGENE.ORG

Technické parametry

Webová aplikace, kombinace Ruby, Javy, Prologu a skriptů statistického systému R na straně serveru

Ekonomické parametry

—

IČO vlastníka výsledku

68407700

Název vlastníka

ČVUT FEL, Katedra kybernetiky