Knowledge Gene: A Novel Feature Extraction Method in Genomics

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F10%3A00176119" target="_blank" >RIV/68407700:21230/10:00176119 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Knowledge Gene: A Novel Feature Extraction Method in Genomics

Popis výsledku v původním jazyce

Dimension reduction is the process of reducing the number of variables under consideration. In genomic classification it is widely applied because the high dimensionality of gene expression data proved to decrease accuracy and comprehensibility of genomic classifiers. Simultaneously, contemporary genomics offers an opportunity to reach beyond the routine application of purely statistical dimension reduction techniques. Availability of a great variability of knowledge on gene roles, functions and gene-gene interactions allows to benefit from knowledge-based approaches to dimension reduction. We extend our previous work, where a priori knowledge-based feature extraction method was introduced. The method called knowledge gene (KG) employs the gene keywords affinity to define a gene similarity measure.

Název v anglickém jazyce

Knowledge Gene: A Novel Feature Extraction Method in Genomics

Popis výsledku anglicky

Dimension reduction is the process of reducing the number of variables under consideration. In genomic classification it is widely applied because the high dimensionality of gene expression data proved to decrease accuracy and comprehensibility of genomic classifiers. Simultaneously, contemporary genomics offers an opportunity to reach beyond the routine application of purely statistical dimension reduction techniques. Availability of a great variability of knowledge on gene roles, functions and gene-gene interactions allows to benefit from knowledge-based approaches to dimension reduction. We extend our previous work, where a priori knowledge-based feature extraction method was introduced. The method called knowledge gene (KG) employs the gene keywords affinity to define a gene similarity measure.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

JC - Počítačový hardware a software

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

S - Specificky vyzkum na vysokych skolach

Rok uplatnění

2010

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

POSTER 2010 - Proceedings of the 14th International Conference on Electrical Engineering

ISBN

978-80-01-04544-2

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

5

Strana od-do

—

Název nakladatele

ČVUT v Praze, FEL

Místo vydání

Praha

Místo konání akce

Praha

Datum konání akce

6. 5. 2010

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—