Sémantická dvojshluková analýza dat genové exprese

Kód výsledku v IS VaVaI
<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F16%3A00300014" target="_blank" >RIV/68407700:21230/16:00300014 - isvavai.cz</a>
Výsledek na webu
<a href="http://www.enbik.cz/enbik2016/abs/u147_p34_s1_L.doc" target="_blank" >http://www.enbik.cz/enbik2016/abs/u147_p34_s1_L.doc</a>
DOI - Digital Object Identifier
—

Jazyk výsledku
čeština
Název v původním jazyce
Sémantická dvojshluková analýza dat genové exprese
Popis výsledku v původním jazyce
Dvojshluková analýza dat genové exprese je používaná bioinformatická metoda pro vyhledávání význačných lokálních vzorů v genové matici. Matice genových expresí je uvedenou metodou analyzována, na rozdíl od klasických jednodimenzionálních shlukovacích metod, současně ve dvou dimenzích: v dimenzi obsahující geny (řádky) a v dimenzi obsahující jednotlivé vzorky (sloupce). Algoritmus pro dvojshlukování tedy identifikuje podskupiny genů v podskupině vzorků. Typickým příkladem sémantického shlukování při analýze genových dat je shlukování genů na základě hodnoty exprese, kde jednotlivé shluky mohou být charakterizovány pomocí termů z Gene ontology.
Název v anglickém jazyce
Semantic Biclustering Analysis of Gene Expression Data
Popis výsledku anglicky
Biclustering is a well-known technique for seeking local patterns in a gene matrix. This matrix is analysed simultaneously in two dimensions that contain genes (rows) and samples (columns). Biclustering algorithm identifies subsets of genes in subsets of samples. Typically, semantic clustering of gene expression matrix is a clustering of genes based on their expression values where each cluster is identified by Gene ontology terms.

Projekt
<a href="/cs/project/GA14-21421S" target="_blank" >GA14-21421S: Automatická analýza prostorových vzorů genové exprese</a><br>
Návaznosti
P - Projekt vyzkumu a vyvoje financovany z verejnych zdroju (s odkazem do CEP)

Rok uplatnění
2016
Kód důvěrnosti údajů
S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Podobné výsledky(10)