Vše

Co hledáte?

Vše
Projekty
Výsledky výzkumu
Subjekty

Rychlé hledání

  • Projekty podpořené TA ČR
  • Významné projekty
  • Projekty s nejvyšší státní podporou
  • Aktuálně běžící projekty

Chytré vyhledávání

  • Takto najdu konkrétní +slovo
  • Takto z výsledků -slovo zcela vynechám
  • “Takto můžu najít celou frázi”

Super-resolution fight club: assessment of 2D and 3D single-molecule localization microscopy software

Identifikátory výsledku

  • Kód výsledku v IS VaVaI

    <a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F68407700%3A21230%2F19%3A00332285" target="_blank" >RIV/68407700:21230/19:00332285 - isvavai.cz</a>

  • Výsledek na webu

    <a href="https://doi.org/10.1038/s41592-019-0364-4" target="_blank" >https://doi.org/10.1038/s41592-019-0364-4</a>

  • DOI - Digital Object Identifier

    <a href="http://dx.doi.org/10.1038/s41592-019-0364-4" target="_blank" >10.1038/s41592-019-0364-4</a>

Alternativní jazyky

  • Jazyk výsledku

    angličtina

  • Název v původním jazyce

    Super-resolution fight club: assessment of 2D and 3D single-molecule localization microscopy software

  • Popis výsledku v původním jazyce

    With the widespread uptake of two-dimensional (2D) and three-dimensional (3D) single-molecule localization microscopy (SMLM), a large set of different data analysis packages have been developed to generate super-resolution images. In a large community effort, we designed a competition to extensively characterize and rank the performance of 2D and 3D SMLM software packages. We generated realistic simulated datasets for popular imaging modalities—2D, astigmatic 3D, biplane 3D and double-helix 3D—and evaluated 36 participant packages against these data. This provides the first broad assessment of 3D SMLM software and provides a holistic view of how the latest 2D and 3D SMLM packages perform in realistic conditions. This resource allows researchers to identify optimal analytical software for their experiments, allows 3D SMLM software developers to benchmark new software against the current state of the art, and provides insight into the current limits of the field.

  • Název v anglickém jazyce

    Super-resolution fight club: assessment of 2D and 3D single-molecule localization microscopy software

  • Popis výsledku anglicky

    With the widespread uptake of two-dimensional (2D) and three-dimensional (3D) single-molecule localization microscopy (SMLM), a large set of different data analysis packages have been developed to generate super-resolution images. In a large community effort, we designed a competition to extensively characterize and rank the performance of 2D and 3D SMLM software packages. We generated realistic simulated datasets for popular imaging modalities—2D, astigmatic 3D, biplane 3D and double-helix 3D—and evaluated 36 participant packages against these data. This provides the first broad assessment of 3D SMLM software and provides a holistic view of how the latest 2D and 3D SMLM packages perform in realistic conditions. This resource allows researchers to identify optimal analytical software for their experiments, allows 3D SMLM software developers to benchmark new software against the current state of the art, and provides insight into the current limits of the field.

Klasifikace

  • Druh

    J<sub>imp</sub> - Článek v periodiku v databázi Web of Science

  • CEP obor

  • OECD FORD obor

    10609 - Biochemical research methods

Návaznosti výsledku

  • Projekt

  • Návaznosti

    I - Institucionalni podpora na dlouhodoby koncepcni rozvoj vyzkumne organizace

Ostatní

  • Rok uplatnění

    2019

  • Kód důvěrnosti údajů

    S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Údaje specifické pro druh výsledku

  • Název periodika

    Nature Methods

  • ISSN

    1548-7091

  • e-ISSN

    1548-7105

  • Svazek periodika

    16

  • Číslo periodika v rámci svazku

    5

  • Stát vydavatele periodika

    GB - Spojené království Velké Británie a Severního Irska

  • Počet stran výsledku

    9

  • Strana od-do

    387-395

  • Kód UT WoS článku

    000466430000019

  • EID výsledku v databázi Scopus

    2-s2.0-85064068699