Isolace bakteriální DNA z velmi humosních stepních půd a následná DGGE Fingerprinting

Kód výsledku v IS VaVaI

<a href="https://www.isvavai.cz/riv?ss=detail&h=RIV%2F70883521%3A28110%2F04%3A63502562" target="_blank" >RIV/70883521:28110/04:63502562 - isvavai.cz</a>

Výsledek na webu

—

DOI - Digital Object Identifier

—

Jazyk výsledku

angličtina

Název v původním jazyce

Isolation of Bacterial DNA from very Humic Steppe Soils and Subsequent DGGE Fingerprinting

Popis výsledku v původním jazyce

In our study we aimed to find the universal procedure which would enable us to get DGGE profiles from larger set of samples where the soils differed substantially in contents of organic matter. Fraction of humic substances displays similar properties toDNA hence it can be uneasy to remove them during DNA isolation process and the substances consequently inhibit PCR. Additional cleaning of isolated DNA appears to be necessary. for most of our samples, two cleanings of isolated DNA (Wizard DNA clean-up systém, Promega) and subsequent tenfold dilution were sufficient. The most problematic sample needed three cleaning steps and tenfold dilution. Our experiences imply that dilution is more useful than additional cleaning for some samples.

Název v anglickém jazyce

Isolation of Bacterial DNA from very Humic Steppe Soils and Subsequent DGGE Fingerprinting

Popis výsledku anglicky

In our study we aimed to find the universal procedure which would enable us to get DGGE profiles from larger set of samples where the soils differed substantially in contents of organic matter. Fraction of humic substances displays similar properties toDNA hence it can be uneasy to remove them during DNA isolation process and the substances consequently inhibit PCR. Additional cleaning of isolated DNA appears to be necessary. for most of our samples, two cleanings of isolated DNA (Wizard DNA clean-up systém, Promega) and subsequent tenfold dilution were sufficient. The most problematic sample needed three cleaning steps and tenfold dilution. Our experiences imply that dilution is more useful than additional cleaning for some samples.

Druh

D - Stať ve sborníku

CEP obor

EE - Mikrobiologie, virologie

OECD FORD obor

—

Projekt

—

Návaznosti

Z - Vyzkumny zamer (s odkazem do CEZ)

Rok uplatnění

2004

Kód důvěrnosti údajů

S - Úplné a pravdivé údaje o projektu nepodléhají ochraně podle zvláštních právních předpisů

Název statě ve sborníku

9th Methodological workshop: Present Methods for Investigation of Microbial Community Biodiversity in Soils and Substrates

ISBN

—

ISSN

—

e-ISSN

—

Počet stran výsledku

4

Strana od-do

120-123

Název nakladatele

Institut of Soil biology AS ČR

Místo vydání

České Budějovice

Místo konání akce

České Budějovice

Datum konání akce

2. 3. 2004

Typ akce podle státní příslušnosti

EUR - Evropská akce

Kód UT WoS článku

—